Pracovní skupina pro výzkum vegetace

Česká národní fytocenologická databáze

Informace pro české uživatele databází a programu Turboveg

Turboveg for Windows

Základním softwarem pro Českou národní fytocenologickou databázi je TURBOVEG (Hennekens & Schaminée 2001, Journal of Vegetation Science 12: 589-591). V České republice může tento software zdarma získat každý amatérský i profesionální botanik, ekolog, student nebo pracovník ochrany přírody zabývající se studiem vegetace, pokud souhlasí s dodržováním níže stanovených podmínek pro práci s databází a je ochoten účastnit se výměny elektronických dat uložených v databázi. TURBOVEG for WINDOWS lze stáhnout zde:

Instalace TURBOVEG for WINDOWS

Pro získání přístupových práv kontaktujte Danu Michalcovou (danmich_at_sci.muni.cz) nebo Milana Chytrého (chytry_at_sci.muni.cz).

Pro zpracování fytocenologických dat uložených v programu TURBOVEG doporučujeme používat program JUICE (Tichý 2002, Journal of Vegetation Science 13: 451-453), který lze zdarma stáhnout zde.

Zásady práce s databází

Každý zadavatel smí zadávat fytocenologické snímky do databáze jen pod určitými čísly přidělenými lokálním koordinátorem. Tím získává jistotu, že pod stejnými čísly nezadává jiné snímky někdo jiný. V rámci stejného číselného rozsahu přiděleného lokálním koordinátorem se zadávají i citace literatury, pokud jsou zadávané snímky přebírány z publikovaných zdrojů.

Autoři, kteří dosud nemají přidělen rozsah čísel, dostanou čísla přidělena při poskytnutí prvního souboru snímků do centrální databáze, tj. číslují své snímky od jedničky, pak celý soubor pošlou koordinátorovi centrální databáze, který jej přečísluje dle aktuálního stavu databáze. Pokud se zadavatel chystá své snímky publikovat, je kvůli odkazování vhodné mít je již s čísly z centrální databáze. Seznam rozsahů čísel, které již byly přiděleny najdete zde.

Pro úplné začátečníky doporučujeme k prostudování stručný manuál popisující vytváření databází a zadávání dat do Turbovegu.

Seznam druhů cévnatých rostlin používaný v TURBOVEGu je modifikovanou verzí díla Liste der Gefäßpflanzen Mitteleuropas (Ehrendorfer 1973) a tam lze najít také většinu synonym pro správný převod nomenklatury. Pokud přesto vzniknou pochybnosti při synonymizaci jmen rostlin, je lépe nepsat daný druh do seznamu druhů ve snímku, ale do databázového pole Remarks, spolu s hodnotou pokryvnosti. Odtud bude po vyjasnění nomenklatorického problému možné kdykoliv v budoucnu tento údaj převést do databáze. Jména mechorostů a lišejníků jsou v databázi podle standardní literatury (Frey et al. 1995, Pišút et al. 1993). Připomínky a návrhy k seznamu druhů prosím adresujte na danmich_at_sci.muni.cz.

Výběry snímků z databáze a formáty vybraných snímků

Kritéria, podle kterých lze vybírat fytocenologické snímky z databáze, a formáty exportovaných snímků najdete zde

Literatura

Ehrendorfer F. (ed.) (1973): Liste der Gefäßpflanzen Mitteleuropas. Ed. 2. - G. Fischer, Stuttgart.
Frey W., Frahm J. P., Fischer E. & Lobin W. (1995): Die Moos- und Farnpflanzen Europas. - G. Fischer, Stuttgart.
Kubát K., Hrouda L., Chrtek J. jun., Kaplan Z., Kirschner J. & Štěpánek J. (eds.) (2002): Klíč ke květeně České Republiky. Academia, Praha
Pišút I., Lackovicová A. & Lisická E. (1993): Súpis lišajníkov Slovenska. - Biológia, 48, Suppl. 1: 53-98.

Současný stav centrální databáze

K 14. srpnu 2009 bylo v centrální databázi uloženo celkem 93 449 fytocenologických snímků z území České republiky. Z tohoto počtu patří nejvíce snímků ke třídám Querco-Fagetea, Molinio-Arrhenatheretea, Phragmito-Magnocaricetea, Festuco-Brometea a Galio-Urticetea.

Fytocenologická bibliografie s vyznačením publikací excerpovaných v centrální databázi je k dispozici zde.

Relativní počty snímků z databáze (k 17. březnu 2010)

Seznam koordinátorů databáze

Centrální koordinace: Dana Michalcová a Milan Chytrý, e-mail: danmich_at_sci.muni.cz, chytry_at_sci.muni.cz
Masarykova univerzita a jižní Morava
Dana Michalcová, e-mail: danmich_at_sci.muni.cz
Botanický ústav Průhonice a Univerzita Karlova
Tomáš Černý, e-mail: tomas.cerny_at_ibot.cas.cz
Jihočeská univerzita a jižní Čechy
Milan Štech, e-mail: stech_at_prf.jcu.cz

Výměna a poskytování dat

Aby mohla být zajištena účinná výměna dat, dovolujeme si požádat všechny uživatele TURBOVEGu, kteří do databáze zadali jakákoliv data z publikované literatury, případně svoje data dříve zadaná do TURBOVEGu publikovali, aby tato data poskytli do centrální databáze na adresu danmich_at_sci.muni.cz nebo chytry_at_sci.muni.cz. Z dat soustředěných v centrální databázi je na druhé straně možné poskytovat výběry fytocenologických snímku, zejména pro spolupracovníky, kteří data sami dodávají. Požadavky lze adresovat na stejné e-mailové adresy.

Aktualizované verze společných databází

POZOR! V současnosti ČNFD využívá NOVÝ SEZNAM DRUHŮ, který vypracoval Jiří Danihelka. Byly doplněny druhy podle Kubát et al. 2002, ale kompatibilita předchozím verzí seznamu je zachována.

Aktuální verze seznamu druhů: species.zip (30. 03. 2010)

Aktuální verze společných databází, tzv. popup seznamů: popup.zip (22. 07. 2010)

Soubor species.zip uložte do složky c:\turbowin\species\C_europe\ a soubor popup.zip do složky c:\turbowin\popup, soubory rozbalte a při rozbalování nechte přepsat všechno, co je už na disku. Tím získáte i aktuální verze seznamu druhů, naší fytocenologické bibliografie a seznamu autorů. Ty si můžete odtud po čase zase stáhnout, budeme je průběžně aktualizovat.

Poděkování

Dovolujeme si poděkovat všem, kteří dosud přispěli k tvorbě databáze:

Denisa Blažková
Karel Boublík
Jana Božková
Jaroslav Čáp
Barbora Čepelová
Tomáš Černý
Jaroslava Cieslarová
David Cigánek
Šárka Cimalová
Pavel Daněk
Jiří Danihelka
Daniel Dítě
Ctibor Dolejší
Jan Douda
Martin Duchoslav
Helena Dušková
Kamila Dvořáčková
Jitka Effmertová
Libor Ekrt
Viktoria Eltsova
Martina Fabšičová
Karel Fajmon
Petr Filippov
Jarmila Filippovová
Michal Gerža
Marek Gonda
Tomáš Grulich
Michal Hájek
Petra Hájková
Jana Halúzová
Petra Hanáková
Helena Havránková
Radim Hédl
Monika Hejdová
Eva Hettenbergerová
Aleš Hoffmann
Viera Horáková
Eliška Horodyská
Lucie Hradilová
Richard Hrivnák
Zdenka Hroudová
Jindřich Chlapek
Markéta Chudomelová
Martin Jiroušek
Blanka Jírů
Jan Juřica
Michal Juříček
Jiří Juřička
Veronika Kalníková
Veronika Kalusová
Katrin Karimová
Petr Karlík
Leoš Klimeš
Ilona Knollová
Martin Kočí
Tereza Koubková
František Krahulec
Lucie Kratochvílová
Zdeněk Kropáč
Tomáš Kučera
Petr Kuneš
Jitka Laburdová
Deana Láníková
Martin Lepší
Zdeňka Lososová
Hana Lukšíková
Pavel Lustyk
Samuel Lvončík
Kristina Merunková
Dana Michalcová
Zuzana Myšková
Tereza Náhlíková
Jana Navrátilová
Lydie Navrátilová
Martina Nejezchlebová
Zdenka Neuhäuslová
Jiří Němec
Jana Nová
Jan Novák
Ivan Ostrý
Zdenka Otýpková
Marcela Paloudová
Petra Pavlíčková
Jan Pergl
Michaela Petrová
Petr Petřík
Zuzana Plesková
Marie Popelářová
Petr Pyšek
Marie Rafajová
Frank Richter
Jan Roleček
Zuzana Rozbrojová
Jiří Rozehnal
Eva Rozehnalová
Marcela Řezníčková
Jiří Sádlo
Vojtěch Sedláček
Hana Sekerková
Martina Sojneková
Zbyněk Sovík
Lenka Staňková
Petr Šmarda
Markéta Špelinová
Kateřina Šumberová
Markéta Táborská
Lubomír Tichý
Jana Tkačíková
Jarmila Urbánková
Adam Veleba
Irena Veselá
Jiří Vicherek
Ondřej Vild
Jaroslav Vojta
Alena Vydrová
Tomáš Vymyslický
Petr Vysloužil
David Zelený
Kristýna Žáková