Z Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost (OPVK) získala PřF MU podporu pro 23 projektů, v rámci kterých inovuje studijní programy, výukové materiály i vybavení laboratoří a učeben.
V dalších 8 projektech figuruje fakulta jako partnerský subjekt. Podstatnou část mezi podpořenými projekty tvoří projekty z oblasti podpory 2.2 Vysokoškolské vzdělávání, které se zaměřují na inovace stávajících a tvorbu nových kurzů pro studenty VŠ.
Na kvalitu a uplatnitelnost absolventů PřF MU mají pozitivní dopad také čtyři infrastrukturní projekty realizované v rámci Operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace (OP VaVpI).
Tyto projekty zaměřené na vybudování nejmodernějších učeben a laboratoří (včetně špičkového přístrojového vybavení) přispívají k rozšíření výzkumných a vývojových kapacit na fakultě a umožňují tak studentům rozvinout svůj potenciál i ve výzkumné sféře.