Doctoral Studies

Biomolecular Chemistry - Field

Topic name: Protein sensitivity of membrane composition

Supervisor: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.

Kontrola složení a tvaru biologických membrán je životně důležitá pro nejen eukaryotické buňky. Organely udržují přesné rozložení lipidů i přes neustálou výměnu materiálu. To je potřebné pro správnou organizaci a funkci membránových proteinů, které tak může buňka řídit v prostoru a čase. Složení membrán je také specifické pro rakovinné buňky, bakterie a obalené viry, čehož může být využito k cílenému a specifickému léčení. Cílem tohoto projektu je zkoumat vliv složení membrány na interakci vybraných proteinů.

Student získá znalosti v oblasti Linuxu, počítačových simulací a molekulového modelování. K výzkumu boudou použity počítačové simulace metodou Molekulové Dynamiky a využitím pokročilých metod analýzy fosfolipidových membrán.

• Vypracování literární rešerše
• Nastudování uvedené odborné literatury a metodiky simulací
• Provedení simulací a analýza získaných dat
• Vyhodnocení a diskuze výsledků
• Vypracování disertační práce