CYTOLOGIE – NAUKA O BUŇKÁCH

 

Materiály slouží ke studiu daného předmětu.

Jiné použití konzultujte laskavě s autorem.

 

Kontakt na učitele: ptacek@sci.muni.cz

 

 (počet přístupů od 23.2.07)

 

 

Anglicko český slovník pro případnou potřebu při studiu obrázků:

http://www.translator.cz/bin/translator        

 

Obsah tématického oddílu

 

 

1.   1.              CYTOLOGIE – I (stavba buněk)

1.1.              1.1.                  Zrod cytologie

1.2.              1.2.                  Dnešní definice buňky

1.3.              1.3.                  nebuněčné formy v živé přírodě

1.4.              1.4.                  Buněčné formy

1.4.1.   1.4.1.         Prokaryota (předjaderní buňky)

1.4.2.   1.4.2.         Eukaryotické buňky

1.4.2.1.   1.4.2.1.     Živočišné buňky

1.5.              1.5.                  Struktura živočišné buňky

 a) Podle tradičního dělení

 b) Podle výsledků elektronové mikroskopie

1.5.1.        1.5.1.            Buněčné obaly

1.5.1.1.   1.5.1.1.     Cytoplazmatická membrána

1.5.1.2.   1.5.1.2.     Průchod látek membránou

1.5.1.3.   1.5.1.3.     Morfologická membrána

1.5.1.4.   1.5.1.4.     Mezibuněčné hmoty

1.5.2.        1.5.2.            Buněčné jádro

1.5.3.        1.5.3.           Jadérko (nucleolus)

1.5.4.      Mitochondrie

1.5.5.      Endoplazmatické retikulum (ergastoplazma)

1.5.6.      Ribozómy

1.5.7.      Dělící tělísko (cytocentrum, centrozóm, periplast)

1.5.8.      Lysozómy

1.5.9.      Golgiho síť (Golgiho aparát, endopegma)

1.5.10.    Mikrotělíska

1.5.11.    Cytoskelet

1.5.12.    Buněčné inkluze (metaplazma)

1.5.13.     1.5.13.       Peroxizómy

 

2.            CYTOLOGIE – II (rozmnožování buněk)

2.1.         AMITÓZA

2.2.         Mitóza

2.2.1.      Chromozómy

2.2.2.      Průběh mitózy

2.2.2.1.   Karyokinéze

 I. Profáze

 II. Matafáze

 III. Anafáze

 IV. Telofáze

2.2.2.2.   Cytokinéze

2.2.3.      Modifikace mitózy

2.2.4.      Ovlivnění mitózy

2.3.              2.3.                  Život buňky

2.3.1.      Buněčná smrt - apoptóza

2.4.         MEIÓZA - dělení redukční (zrací)

2.4.1.      První zrací dělení

2.4.1.1.   Profáze

 a) Leptotenne

 b) Zygotenne

 c) Pachytenne

 d) Diplotenne

 e) Diakineze

2.4.1.2.   Metafáze 1. zracího dělení

2.4.1.3.   Anafáze 1. zracího dělení

2.4.1.4.   Telofáze 1. zracího dělení

2.4.2.      Druhé zrací dělení

2.4.3.        2.4.3.            Průběh meiózy

 

3.                     3.                          Struktura DNA a přepis genetické informace

3.1.               3.1.                    DNA – primární, sekundární a terciální struktura

3.2.               3.2.                    Mitochondriální DNA

3.3.               3.3.                    Replikace DNA

3.4.               3.4.                    Přehled transkripce a translace

3.5.               3.5.                    DNA - RNA  (transkripce)

3.6.               3.6.                    RNA – bílkoviny (translace)

3.7.               3.7.                    Struktura ribozómů

 

4.              Literatura, odkazy

 

 

CYTOLOGIE – I (stavba buněk)                                                                          

 

1.1. Zrod cytologie (URL 1)

 byl podmíněn objevem mikroskopu koncem 16. století.

 

Objev mikroskopu: Holanďané J.a Z. Jansenovi (1590, URL 2) vybrousili první čočky a sestrojili mikroskop. Italové připisují objev mikroskopu družině kolem Galilea Galileiho (1564 –1642, URL 3). Ital Stelluti (1630) poprvé pozoroval objekty mikroskopem, Ital Marcelo Malpighi (1628-1694) popsal struktury některých orgánů stejně jako Angličan Grew (1641-1711).

Nejvýznamnějším průkopníkem mikroskopie byl Holanďan Antony van Leeuwenhoek (1632-1723, URL 5). Prováděl rozsáhlá pozorování prvoků, hub, bakterií a jiného biologického materiálu. Za pomoci Regniera Graafa informoval Royal Society v Anglii o svých objevech ve 120 obsáhlých dopisech. V roce 1677 objevil spermie a kapiláry (odvolává se na Malpighiho), a v roce 1680 byl  zvolen členem Pařížské akademie věd. Objevil prvoky (1675) a bakterie (1683). Měl mikroskop velmi dobré kvality. Regnier Graaf (1641-1673) byl lékař (folikul ve vaječnících), člen anglické  Royal Society, introvert, který neovládal latinu. Po nocích pozoroval vlasy, kůži, vlákna, prvoky a vše zakresloval.

 

Buňku poprvé popsal Angličan Robert Hooke (1635 –1703, URL 8). Zkoumal parafinové řezy rostlinného materiálu – např. korek, ve kterém pozoroval mnoho komůrek (buňky).  V práci nazvané Micrographia (1665) zveřejnil pojednání o použití a výkonnosti jím sestrojeného drobnohledu a shrnul všechny dosavadní poznatky.

 

Jádro s jadérkem definoval Fontana (1781) jako vejčitá tělíska se skvrnkou. Dutrochet (1824) objevil, že těla živočichů jsou také z buněk (granula, zrnéčka). Dále pak se na rozvoji cytologie podílela celá řada dalších badatelů včetně J.E. Purkyně (1787 – 1869, URL 4). Ten první poukázal na skutečnost, že všechny rostlinné i živočišné tkáně se skládají z buněk, a také jako první použil na přípravu preparátů mikrotom. Narodil se v Libochovicích, studoval na UK v Praze fyziologii smyslové a nervové činnosti. Působil jako lékař a profesor fyziologie ve Vratislavi a později v Praze, kde také založil Fyziologický ústav. Na základě dřívějších poznatků i svých vlastních pozorování vyslovil jako jeden z prvních myšlenku tzv. buněčné teorie, podle které je buňka základní stavební jednotkou všech organismů. Od Purkyněho pochází také název protoplazma (1937), označující živou hmotu obsaženou v buňkách. Popsal několik typů (URL 9) nervových buněk, které byly po něm pojmenovány. Purkyněho jev (změna poměrné světelnosti barev při adaptaci oka na tmu).

 

Vlastní zrod cytologie spadá do první poloviny 19. století. Mezi zakladatele cytologie patří především M. Schleiden (1804 –1882, URL 196) a  T. Schwann (1810 –1882, URL 197), kteří formulovali buněčnou teorii. Schwannův spis z r. 1839 vzbudil značnou pozornost, a proto je buněčná teorie označována nejčastěji jako teorie Schleiden-Schwannova. Tito autoři se však domnívali, že nové buňky vznikají novotvořením z mezibuněčných hmot, které označovali jako cytoblastém. Na rozdíl od Purkyněho nevěnovali pozornost buněčným obsahům. Louis Pasteur (1822-1895, URL 198) kromě jiného prokázal, že kvašení nemusí být vázáno na živou nepoškozenou buňku. Robert Koch (1843-1910, URL 199) založil obor bakteriologie, Ilja Mečnikov (1845-1916, URL 200) začal studovat imunitu, Paul Ehrlich (1854-1915, URL 201) položil na vědecký základ chemoterapii.

Botanik M. Schleiden  v čas. Beiträge zur Phytogenesis definuje buňku a vytváří buněčnou teorii: těla rostlin nejsou celistvá, ale skládají se z buněk. Setkává se s Theodorem Schwannem, který vydává dílo o živočišné buňce. Věřili v novotvoření z cytoblastému mezi buňkami.

Nägeli (1844) - buněčné jádro existuje nejen u rostlin, ale i hub a řas. Rovněž pozoroval, ale nepochopil mitózu. W. Hoffmeister  podrobně popsal nepřímé dělení buněk.

Němec Virchow (1821 –1902, URL 202) první poukázal na skutečnost, že každá buňka vzniká jen rozdělením již existující buňky („Omnis cellula ex cellulae“). Počátky buněčné struktury a života vůbec viděl v tvůrčím aktu Boha.

Max Schultze  objevil (1861), že buňky všech organismů jsou složeny z protoplazmy a obsahují  jádro.

 

Na tuto situaci navazuje rozvoj cytologie v souladu s technickými možnostmi - zdokonalování optiky, mikrotomů a metod studia živé hmoty. Až do objevu elektronového mikroskopu však zůstalo mnoho nejasného při pozorování detailnějších struktur.

 

Další český cytolog F. Vejdovský (1849 –1939, URL 203), profesor zoologie v Praze, první popsal centrozóm a periplast (1886). Studoval struktury chromozómů. V r. 1835 se mu podařilo pozorovat mitózu, nepochopil však její význam.

 

Mezitím se objevila teorie abiogeneze: vznik života z neživé hmoty - Oparin (1894-1980), J.B.S. Haldane (1892 –1964, URL 204).

Oparin byl ruský biochemik, který současně s Američanem Haldanem vytvořil teorii o vzniku života na základě chemických a fyzikálních procesů. Byl silně ovlivněn Darvinovou evoluční teorií. Podle jeho teorie život vznikl v podstatě náhodou, vývojem od jednoduchých až po komplexní organické sloučeniny, schopné vlastní duplikace.

 Mezi nejvýznamnější práce minulého století, zakládající možnosti rozvoje moderní biologie ve století dvacátém, patří práce Darwinovy (1809 –1882, URL 205), vysvětlující mechanismus evoluce, a práce Gregora Mendela (1822 –1884, URL 206), objasňující principy dědění vlastností. Jinak se však biologové v minulém století a ještě i v počátcích tohoto století zaměřovali především na popis organismů a buněk a na jejich systematické třídění.

Dvacáté století je ovšem všeobecně považováno za století vědy a technického pokroku. První polovině tohoto století dominovaly fyzika a chemie, ale druhá polovina je charakterizována rychlým rozvojem biologie. Ten byl zprvu založen zejména na aplikaci metod chemie na výzkum pochodů v živém organismu. Důležitý je posun od popisného přístupu k dynamické biochemii a přenesení Darwinovy evoluční teorie i Mendelových zákonů dědičnosti na molekulární úroveň.

Po objevu elektronového mikroskopu  (E. Ruska a M. Knoll, 1932, URL 207) nastal další rozvoj cytologie.

Byla objevena celá řada tzv. submikroskopických struktur, které jsou součásti komplexu zvaného buňka.

 

 

 

Optimální zvětšení

 

Maximální rozlišovací schopnost

Lidské oko

 

0,1 – 2 mm

Optický mikroskop

20 - 2000 x

do 100 nm

Elektronový mikroskop

1 000 – 250 000 x

0,5 nm

 

 

Názorná stupnice zvětšení:

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Světelný mikroskop:> 0,2 μm

-                -                   konvenční

-                -                   fázový kontrast

-                -                   interferenční kontrast

-                -                   fluorescence

-                -                   konfokální laserový skenovací

 

Elektronový mikroskop: :> 0,2 nm

-                -                   transmisní

-                -                   skenovací

skenovací

 

 

 

Nelze opomenout důležité práce Otto Warburga (1883 -1970), Hanse Krebse (1900 -1981) a dalších, kteří položili základ současné biochemie. Zejména Krebsova koncepce biochemických cyklů reakcí, v nichž se tvoří a spotřebovává energie a jíž se organismy zbavují jedovatých zplodin metabolismu, vytvořila základ pro pochopení toho, jak pracuje buňka.

Snad nejvýznamějším posunem v poválečné biologii byl vznik oboru molekulární biologie. Mnozí ztotožňují vznik molekulární biologie s objasněním struktury deoxyribonukleové kyseliny (DNA) a s funkční implikací této struktury. Vskutku, až do práce Jamese D. Watsona a Francise Cricka z počátku padesátých let nebyla úloha DNA v uchovávání a přenosu dědičné informace všeobecně uznávána. Pokusy Averyho a Oswalda s bakteriemi v třicátých a čtyřicátých letech sice naznačovaly, že by DNA tuto úlohu mohla plnit, ale protože chyběl jakýkoliv náznak možného mechanismu, nebyla tato interpretace všeobecně přijímána.

V té době se za základ života považovaly proteiny (bílkoviny). Vědělo se, že enzymy, umožňující chemické reakce v buňce, jsou proteinové povahy, a proto se mnoho úsilí věnovalo, a stále ještě věnuje, studiu proteinů. Vznikl obor enzymologie. Vlastnosti enzymů jsou natolik různorodé a jejich funkce natolik udivující, že se jaksi bez důkazu a bližšího vysvětlení předpokládalo, že to jsou proteiny, které zprostředkovávají, zatím neznámým mechanismem, dědění vlastností.

Strukturní biologie, založená v Cambridgi, však tvoří jen jednu větev molekulární biologie. Za druhé světové války a hned po válce studovali někteří fyzici v USA pomnožování bakteriálních virů (bakteriofágů). Byli to zejména Max Delbrück (URL 208) a Salvador Luria, kteří si uvědomili výhody experimentálního modelu bakteriálních virů. Tyto výhody spočívají v tom, že v krátkém čase (řádově desítky minut) lze získat početné populace virů, tedy nové generace organismů (či alespoň biologických objektů, které mají mnohé vlastnosti organismů). Na tomto modelu pak konečně bylo nade vší pochybnost prokázáno, že nositelem dědičné informace je nukleová kyselina. A nejen to. Studiem těchto poměrně jednoduchých systémů se podařilo definovat a prostudovat do značných podrobností molekulární podstatu mnoha základních pochodů při uchovávání a přenosu dědičné informace. Vznikl obor molekulární genetiky. Současná molekulární biologie je syntézou těchto dvou směrů, tedy strukturní biologie a molekulární genetiky. A mimořádně plodná je další syntéza, a sice výsledků molekulární biologie a studia buněk a celých organismů: daří se porozumět funkcím buněk a organismů v termínech molekul.

V šedesátých letech se biochemickými a molekulárně biologickými metodami podařilo nahromadit významné množství informací o molekulární podstatě života, o přenosu genetické informace z rodičů na potomstvo, o mechanismech regulujících látkovou výměnu a o chemických reakcích tvořících podstatu životních pochodů v buňkách.

V roce 1966 byl rozluštěn genetický kód, na němž je založen překlad dědičné informace uložené v DNA do funkčních molekul proteinů. K velmi důležitým objevům došlo ve Francii v laboratořích Francoise Jacoba, Jacquese Monoda a André Lwoffa. Zejména Monod (URL 209) ovlivnil celou generaci biologů svou knihou Náhoda a nutnost (i když dnes nejsou Monodovy myšlenky všeobecně přijímány). Tito vědci položili základ k řešení snad nejdůležitějšího problému současné biologie, kterým je podstata diferenciace buněk do orgánů a tkání a vývoj organismů. Studovali molekulární mechanismy regulací a jejich práce, provedené na bakteriích a bakteriofágách, tvoří pevný základ dnešního pohledu na podstatu diferenciace.

Velmi účinné metody pro studium mechanismů řídících životní pochody vznikly na základě Watsonem, Crickem a Franklinovou  (URL 157) objevené vlastnosti DNA, a sice na tom, že se molekuly DNA skládají ze dvou vláken obtočených kolem sebe do známé dvoušroubovice. Spojení obou vláken DNA je velmi specifické a přesné a na základě této přesnosti je možné zjišťovat a analyzovat přítomnost i malých specifických úseků DNA ve velmi heterogenních směsích molekul DNA. Při studiu DNA vyšších organismů těmito metodami se v sedmdesátých letech ukázalo, že genetická informace je v buňkách těchto vyšších organismů uspořádána principiálně jinak než genetická informace bakterií a virů. Následovala řada objevů, které dokazovaly, že i mechanismy, jimiž je dědičnost uchovávána a využívána u vyšších organismů, jsou daleko složitější než jak ukazovala zjednodušená představa získaná studiem bakterií a bakteriofágů.

 

1.2. Dnešní definice buňky:                                                                

Buňka (URL 120) je okrsek protoplazmy ohraničený na povrchu jemnou cytoplazmatickou membránou a od vnějších vlivů chráněný zpravidla silnější morfologickou blánou buněčnou (buněčnou stěnou). Vlastní protoplazma je rozlišena na jaderný obsah (karyoplazmu) a ostatní živou hmotu (základní cytoplazma). V cytoplazmě nacházíme různé struktury.

Jako celek je buňka  základní a současně minimální morfologickou a funkční jednotkou živé hmoty, která je schopná samostatné existence. Pojem minimální zde znamená, že není dělitelná na jednodušší složky, které by vykazovaly všechny základní znaky živé soustavy, a současně i to, že všechny složitější živé soustavy obsahují buňku jako strukturální a funkční subsystém.

 

1.3. NEBUNĚČNÉ FORMY V ŽIVÉ PŘÍRODĚ

Přechod mezi makromolekulami a buňkou tvoří nebuněčné organismy: priony, viroidy a viry.  Konají jen některé ze základních funkcí živých organismů. Rozmnožují se s využitím biochemie hostitele. Jsou to parazité, jejichž základ tvoří bílkoviny (priony) nebo nukleové kyseliny (ostatní). Nebuněčné formy života jsou považovány za degenerované organismy. Musely vzniknout později než buňky hostitele, protože  jsou vázány na jejich metabolismus.

 

Priony (URL 210,  URL 211) jsou bílkovinné částice parazitující na nervových buňkách savců (Jacobova nemoc u člověka). Je to v podstatě složitý specifický protein, který je netypicky zformován - a právě toto zvláštní zformování dělá z prionů to, čím jsou. Když se prion dostane do kontaktu s normálním proteinem v mozku, nezničí ho, ale zatím z neznámých důvodů protein začne napodobovat prion a formovat se podle něj. Stane se vlastně prionem. Postupně se většina proteinů v mozku změní na priony, a mozek se tak mění v houbovitou hmotu. Není dosud známo, proč tělo nemůže priony na rozdíl o běžných proteinů štěpit. Mimo to jsou priony těžko zničitelné. Nepodaří se je všechny zlikvidovat ani při teplotě vyšší než 135 °C. Dokonce se některé priony udržely i v mase, které bylo po celou hodinu vystaveno teplotě 360 °C. Stejně je tomu s pohřbíváním krav. Po třech letech sice těla krav zetlela, ale priony jsou stále na místě. Do lidského těla se priony dostanou pravděpodobně nakaženou potravou, tedy trávicím ústrojím. Po síti nervových buněk pak putují do mozku.

Obrázek: Srovnání normálního proteinu s patogenním prionem. Normální protein (vlevo) obsahuje aminokyseliny uspořádané v α-šroubovici. Infekční prion (vpravo) vzniká, když se oblasti aminokyselinového řetězce se strukturou α-šroubovice rozvinou a vytvoří v proteinu β-konformaci. Převzato z www.

Gen pro syntézu těchto bílkovin je asi běžně v genomu savčích buněk. Aktivita nastává jen za určitých podmínek. Podařilo se izolovat prionový gen, jehož produkt byl schopen vyvolat onemocnění u pokusných zvířat. Při bližším zkoumání zjistilo, že existují dva druhy prionů. První druh bývá označován jako PrPc (celulární), který se běžně vyskytuje ve všech organismech a nevykazuje žádné známky infekčnosti. Jeho funkce v organismu je dosud neznámá. Naproti tomu PrPsc (scrapie) se vyznačuje bodovou mutací na jedné z aminokyselin. Tento druh se ještě dále dělí na 3 poddruhy dle bodové mutace, se kterou souvisejí i druhy chorob, které způsobuje. K přeměně PrPc na PrPsc dochází pravděpodobně mutací v jedné z buněk, kdy vzniká PrPsc, tento se následně naváže na PrPc a dosud neznámým způsobem jej přemění na PrPsc. Dochází tak k řetězovité reakci ("dominový účinek"). Priony se nahromadí v mimobuněčném prostoru, kde se shlukují v masu (vytvoří tzv. amyloidní plak). Krátký průběh nemoci s dlouhou inkubační dobou svědčí o tom, že se priony tvoří exponenciální řadou.

 

    

Vlevo prion způsobující onemocnění mozku, vpravo normální protein, běžně se v mozku vyskytující. Největší rozdíl je v oblasti hlavní α-šroubovice, znázorněné žlutočerveně. U patogenního prionu šroubovice po 5 otáčkách končí, zatímco v normálním proteinu má 7 otáček. Srovnání sekvencí ukazuje jejich podobnost, což podporuje teorii o tom, že tyto choroby způsobuje špatná prostorová struktura molekuly proteinu. Převzato z www.

  

Viroidy  (URL 212) jsou nejmenší známé patogeny. Tvoří je jednovláknová kruhová molekula RNA (kolem 300 nukleotidů) v hostitelské buňce. Tato molekula se v určitých místech stáčí do dvouřetězcových oblastí. Toto vnitřní párování bazí jim dává v nativním stavu jejich charakteristický tvar tyčinky.Viroidy nemají bílkovinný obal. Podle obecně přijímaného modelu struktury se částice viroidu skládá z několika oblastí:

1   Centrální část, která vykazuje vysokou hladinu homologie mezi viroidy téže taxonomické skupiny.

2       2        Patogenní oblast, vykazující homologii mezi viroidy s podobným rozsahem hostitelů. Mutace v této oblasti mohou ovlivnit  infekčnost viroidu a symptomy napadení.

3       3        Proměnná oblast s vysokou sekvenční variabilitou,

4       4        Dvě koncové oblasti.

  

(URL 24)

 

 Pomocí RNA polymerázy se syntetizuje mnoho kopií. Infikované buňky vykazují změny v cytoplazmatické membráně, jadércích a chloroplastech. Organismy vykazují defekty v morfogenezi, případně dochází ke smrti hostitele. RNA viroidů kóduje jediný protein, tzv. delta antigen. Jsou patogenní pro rostliny (brambory, okurky, citrony). Šíří se mechanickou cestou mezi rostlinami téže populace. Jejich přenos hmyzem nebyl dosud prokázán.  V poslední době byly však popsány i u onemocněné lidí hepatitidou D (v tomto případě je viroid uzavřen v kapsuli viru hepatitidy B)

 

 

 

Viry a bakteriofágy (URL 213)

Jsou to nebuněčné organismy, schopné rozmnožování pouze v hostitelských buňkách (tzv. nitrobuněční molekulární parazité). Nemají vlastní aparát pro syntézu bílkovin, ribozómy a t-RNA, ani vlastní metabolický aparát. Je to vlastně infekční nukleová kyselina, jejíž životní projevy jsou úzce spjaty s hostitelskou buňkou. Viry bakterií se nazývají bakteriofágy. Jednotlivá částice viru, schopná infikovat buňku, se nazývá virion. Jeho velikost se pohybuje v rozmezí 15-390 nm. Vnější vrstvu tvoří bílkovinný obal (kapsid), s geometricky pravidelnou strukturou (složený z 42-252 kapsomer). Uvnitř se nachází nukleová kyselina - RNA nebo DNA. Podle toho rozlišujeme RNA viry (většina rostlinných virů) a DNA viry (většina živočišných virů). Na rozdíl od vyšších organismů se v organismu viru nikdy nevyskytují obě tyto kyseliny současně. DNA viry i RNA viry vytvářejí v napadené buňce kopie svých nukleových kyselin i bílkovin. Receptorem je specifická bílkovina buňky v membráně. Specifické virové receptory se kromě membrány hostitelské buňky nacházejí i ve stěně viru. Virus napadne jen takovou buňku, která má na svém povrchu bílkovinu sloužící jako receptor. Některé viry nejsou příliš specifické, každopádně ale není známo, že by některý dokázal současně napadat prokaryotické i eukaryotické buňky.

 Některé viriony mají uvnitř kapsidů kromě nukleové kyseliny ještě jeden nebo více enzymů, potřebných k zahájení své reprodukce uvnitř hostitelské buňky. Někdy se kolem kapsidu nachází ještě membránový obal tvořený bílkovinami a fosfolipidy (pokud má virus kolem kapsidy ještě další ochranný obal, zpravidla ho získal z biomembrány hostitelské buňky, kterou se obalil, když buňku opouštěl.). Virové bílkoviny jsou vždy specifické a udělují viru antigenitu.

 


Základní životní cyklus viru:

l) Jako klidová forma mimo hostitelskou buňku v neživém prostředí.

2) Infikuje hostitelskou buňku a rozmnožuje se v ní.

3) Jako virion je po rozpadu buňky uvolňován do prostředí.

 


 Průběh virové infekce:

1)       1)        Přilnutí viru na povrchu buňky: Aby se virus mohl přichytit, musí mít hostitelská buňka na svém povrchu specifické receptory (buňka je citlivá na virus). Nositelem specifity je membránový obal (u virů bez obalu kapsid). Některé viry, převážně rostlinné, pronikají do buňky i nespecificky, mechanicky. Kromě citlivosti k viru rozlišujeme ještě permisivitu buňky, tj. schopnost buňky uskutečnit genetický program nukleové kyseliny viru poté, kdy vnikla do buňky.

2)       2)        Vniknutí viru do buňky - buď vniká jen nukleová kyselina (u bakterií), nebo celý virus (u živočišných buněk). V tomto případě je membránový obal a kapsid  rozložen hydrolytickými enzymy buňky.

3)       3)        Podle genetických informací obsažených v nukleové kyselině viru se v hostitelské buňce začnou syntetizovat enzymy, z nichž jeden způsobí rozpad chromozomů hostitelské buňky. Virová nukleová kyselina se replikuje 100x až 1000x. Okolo každé nukleové kyseliny se vytvoří ochranný kapsid. Hostitelská buňka praskne (lyzuje) a viriony se uvolní do prostředí.

Nukleové kyseliny viru se někdy včleňují do nukleové kyseliny (chromozomu) hostitelské buňky a stanou se její součástí.Tento tzv. virový chromozom je předáván dceřinným buňkám jako tzv. provirus. Za určitých podmínek (chemických, fyzikálních) může provirus udělit hostitelské buňce nové vlastnosti - nejčastěji se buňka stává buňkou nádorovou.

Bakteriofág se váže na buněčnou stěnu bakterie.

Bakteriofág injikuje svůj genetický materiál do bakterie

Replikace genomu bakteriofága.

Pokračuje produkce komponent bakteriofága a enzymů.

Z komponent se vytváří fágové částice

Enzymy bakteriofága rozruší bakteriální stěnu a obsah se uvolní

Copyright Dr. Gary Kaiser. S laskavým svolením.

 


    Příklady virových onemocnění

U rostlin: mozaiková onemocnění tabáku, brambor, rajčat.

U zvířat: kulhavka a slintavka hovězího dobytka, vzteklina, myxomatoza králíků, mor u drůbeže.

U člověka: dětská obrna, rýma, chřipka, spalničky, klíšťová encefalitida, opar, infekční žloutenka.

                                                                                                                                                                                 

Klasifikace virů  (URL 176)                                                                     

V současné době je známo několik desítek tisíc druhů viru. Spektrum jejich hostitelů je velmi široké. Jejich morfologická stavba je však celkem stejnorodá. Proto se jejich základní klasifikace opírá o jejich hostitelské spektrum. V takto pojatém systému rozlišujeme čtyři základní skupiny virů: prokaryotické viry, rostlinné viry, mykoviry a živočišné viry.


 Prokaryotické viry

Jsou to viry baktérií (bakteriofágy) a sinic (cyanofágy).
Bakteriofág se na rozdíl od virů skládá ze tří složek: hlavičky, bičíku a bičíkových vláken. Rozeznáváme vnitřní hlavovou část s nukleovou kyselinou (RNA-fágy, DNA-fágy), a obal tvořený bílkovinami. Bakteriofágy jsou schopny se vázat pouze na specifické receptory bakteriálnich buněk a pouze v nich realizovat svůj reprodukční cyklus. Jsou důležitým činitelem v udržování ekologické rovnováhy bakteriálnich společenstev. Určité uplatnění nalézají bakteriofágy v medicíně, kde slouží    k prevenci i léčbě některých bakteriálních onemocnění.
Cyanofágy jsou velmi podobné bakteriofágům. Jejich viriony mají ikosahedrickou hlavičku a krátký helikálni bičík. V hlavičce je uložena vždy DNA.

 

Převzato z URL 112, viz též URL 190 a URL 191 (čb.).



Rostlinné viry


Mají většinou helikální strukturu virionu, což je dáno tím, že jsou to převážně RNA-viry. Jednotlivé druhy virů způsobují různé choroby rostlin. Příznaky napadení rostliny bývají velmi podobné: zpomalení růstu, svíjení a deformace listů, odbarvování a projasňování cév a často chlorotické až nekrotické skvrny, dobře patrné na pozadí zdravého pletiva. Rostlinné viry jsou nejčastěji přenášeny hmyzem, parazitickými hlísty a houbami.

 


Mykoviry


Jsou to viry napadající buňky hub. Nejznámější jsou mykoviry plísní a kvasinek. Vyskytují se jak ve formě RNA-mykovirů, tak i DNA mykovirů. Je pro ně typický spíše latentní než lytický průběh infekce.


Živočišné viry

Jsou nejlépe prostudovanou skupinou virů, protože mnohé z nich jsou původci vážných onemocnění člověka. Přenášejí se vzduchem (kapénková infekce), hmyzem, potravinami, vodou, přímým kontaktem s kůží infikovaného, tělními sekrety (moč, sperma, sliny) a krví.  Dělíme je do čtyř hlavních skupin:


1. Neobalené DNA-viry. Mají ikosahedrickou strukturu kapsidu, ve kterém je jednořetězcová DNA. Napadají hmyz, ptáky i savce včetně člověka. Patří mezi ně následující čeledi virů:

a)    a)     Papovaviry (Papovaviridae) jsou onkogenní viry savců. U člověka je z této skupiny znám virus bradavic.

b)    b)     Adenoviry (Adenoviridae) jsou viry infikující dýchací soustavu ptáků a savců. Některé z nich mohou být onkogenní.

c)    c)     Iridoviry (Iridoviridae) jsou typické hmyzí viry, které nejsou přenosné na člověka.

 

2. Obalené DNA-viry. Jsou to viry, které mají na povrchu bílkovinného kapsidu fosfolipidovou membránu.

a)    a)     Herpesviry (Herpesviridae) jsou velmi pestou a početnou čeledí virů. Působí infekční opary různých druhů ptáků a savců včetně člověka. Některé z nich jsou onkogenní. 

b)    b)     Bakuloviry (Baculoviridae) jsou výhradně hmyzí viry.

c)    c)     Poxviry (Poxviridae) tvoří velmi početnou čeleď virů. Patří mezi ně mnoho virů patogenních pro hmyz, ptáky a savce (viry kravských neštovic, myxomatózy a fibromatózy králíků).


3. Neobalené RNA-viry mají na svém povrchu pouze bílkovinný kapsid, obsahují jednořetězcovou RNA. Patří k nim

a)    a)     Reoviry (Reoviridae). Jde o skupinu virů známých i u rostlin, které infikují široké spektrum živočišných hostitelů. Většina infekcí probihá bez příznaků. Některé druhy však mohou způsobovat střevní průjmovitá onemocnění


4. Obalené RNA-viry mají na povrchu kapsidu kromě bílkovinných molekul ještě i fosfolipidovou membránu hostitelské buňky.

a)    a)     Paramyxoviry (Paramyxoviridae). Do této čeledi patří celá řada původců onemocnění člověka (viry spalniček, zarděnek a příušnic) a řady savčích a ptačích druhů.

b)    b)     Rabdoviry (Rhabdoviridae) zahrnují řadu savčích, hmyzích, ale i rostlinných virů. Z virů nebezpečných pro člověka k nim patří virus vztekliny.

c)    c)     Bunyaviry (Bunyaviridae) jsou viry přenášené členovci na savce, u kterých vyvolávají záněty mozku (encefalitidu).

d)    d)     Togaviry (Togaviridae). Zástupci této čeledi jsou původci některých závažných onemocnění člověka, např. žluté zimnice nebo klíšťové encefalitidy. Jsou to virózy přenášené členovci.

e)    e)     Retroviry (Retroviridae) tvoří rozsáhlou čeleď virů, které mohou způsobovat vznik zhoubných nádorů (sarkomy, lymfomy či leukémie). Jsou to viry ptáků a savců. Jejich nositelem genetické informace je jednořetězcová RNA; zvláštní enzym - reversní transkriptáza - podle ní syntetizuje komplementární DNA, která se vřazuje do DNA hostitelské (infikované) buňky. Do této čeledi pak patří v poslední době často diskutovaný virus HIV (URL 213)

 

 

 

 

 

 

              

virus HIV
 



1.4. BUNĚČNÉ FORMY

Organismy: Podle složitosti je dělíme na

a)  jednobuněčné

b) jednobuněčné v koloniích (stejné buňky)         

c) mnohobuněčné (diferenciace buněk)

 

Rozlišujeme dva základní typy (URL 214) strukturálně odlišných buněk, buňky prokaryotní (prokaryotické) a eukaryotní (eukaryotické). Základem tohoto dělení je odlišná struktura jádra. Eukaryotická buňka se vyznačuje tím, že je poměrně veliká, složitá, má dobře rozlišené jádro oddělené membránou a v cytoplazmě řadu organel nejrůznějších tvarů a funkcí. Prokaryotická buňka je malá, jednoduchá, bez ohraničeného jádra a rozlišených organel. Do říše prokaryot byly zařazeny bakterie a sinice, eukaryota pak zahrnují vše ostatní a jsou rozdělena na čtyři říše.

V 60. letech se začal prosazovat názor, že chloroplasty a mitochondrie jsou původně prokaryotické buňky, které byly kdysi dávno v minulosti pozřeny a ve svém hostiteli tak zdomácněly, že si dnes život jeden bez druhého nedovedou představit. Tato endosymbiotická hypotéza je dnes dobře doložena a všeobecně uznávána. Mitochondrie a chloroplasty mají vlastní, byť degenerovanou DNA a proteosyntetický aparát, jsou nápadně příbuzné některým současným bakteriálním druhům a jsou obaleny dvěma cytoplazmatickými mebránami rozdílného charakteru: vnitřní membrána je spíše bakteriální, vnější membrána je hostitelova.

                                                                                                                                                                                                          

 

 

1.4.1. Prokaryota (předjaderní buňky) (URL 215 )

Vznikly před 3-3.5 miliardami  let, jak dokazují africké usazeniny. Mají drobnou velikost (1-2 μm) a rozmanitý tvar. Jejich stavba je jednoduchá. Mají jen jeden systém buněčných membrán (plazmolema). Jaderný materiál není oddělen od základní cytoplazmy.

 

 

 

Bakterie na epitelové buňce v lidských ústech. Bakterie jsou malé tmavé body a čárky. Oválná tmavá oblast uprostřed je jádro epitelové buňky.

Copyright Dr. Bary Kaiser. S laskavým svolením.

 

 

 

Cytoplazmatická membrána vytváří vchlípením enzymatické systémy (výběžky), mesozómy pro dýchání buňky, oxidativní fosforylaci(složité membránové struktury) s tvorbou ATP.

Na membránu zevnitř nasedají ribozómy. Oblast jádra je bez membrány a obsahuje vlákna DNA - bakteriální chromozóm haploidní. Za nepříznivých podmínek vznikají spory. Velikost buněk o řád jednodušší i menší, o řád rychlejší metabolismus (30 min. buň. čas.)

Bylo zjištěno, že všechny prokaryotické organizmy lze zařadit do dvou zásadně odlišných skupin: archebakterie (URL 216) a eubakterie. V dnešní době dělíme veškeré organizmy do tří skupin: Eukarya (označované i jako eukaryota), Bacteria (eubakterie), mezi které patří kromě bakterií i sinice (URL 217) neboli modré řasy, a Archaea (archebakterie). Archebakterie žijí často v extrémních podmínkách (např. v horkých pramenech Yellowstonského parku, nebo v hlubokomořských vývěrech horké vody při teplotách značně vyšších než 100oC). Mají geny zcela nepodobné běžným bakteriím, dokonce se u nich dost často nacházejí geny, které jsou spíše podobné genům vyšších organismů, například i genům lidským.

Jak archebakterie, tak i eubakterie jsou prokaryotické organismy: mají uzavřenou kruhovou molekulu DNA, spojenou transkripci a translaci a obvykle se množí dělením. Jsou však mezi nimi některé rozdíly. Jeden z nich je ten, že využívají různé metabolické cesty. Také se liší v počtu ribozomálních proteinů a ve velikosti a tvaru ribozomální S jednotky. Genom eubakterií je skoro dvojnásobný, a také obsahují více plazmidů než archebakterie.

Archebakterie také nemají ve svých buněčných stěnách kyselinu muramovou, obsahují introny a jsou rezistentní k antibiotikům která působí na eubakterie.

Archebakterie se podobají eukaryotům tím, že mají několik druhů RNA polymerázy, mají větší počet histonům podobných proteinů, jejich DNA tvoří nukleozomy a obsahují introny. U obou zahajuje translaci methionin a mají homologní transkripční systém. Tyto podobnosti řadí archebakterie blíže k eukaryotům než k eubakteriím.

 

Characteristika

Bacteria

Archaea

Eukarya

Obal jádra

nemá

nemá

přítomen

Organely ohraničené membránou

nemá

nemá

přítomen

Peptidoglykan v buněčné stěně

přítomen

nemá

nemá

Membránové lipidy

Nerozvětvené uhlovodíky

Některé rozvětvené uhlovodíky

Nerozvětvené uhlovodíky

RNA polymeráza

Jeden druh

Několik druhů

Několik druhů

Aminokyselina startující syntézu proteinů

formyl-methionin

methionin

methionin

introny

nemá

přítomen

v některých genech

přítomen

Citlivost

k antibiotikům

Streptomycin a chloramfenikol inhibuje růst

 

Tato antibiotika neinhibují růst

Tato antibiotika neinhibují růst

 

 

 

Součásti protocytu (URL 218)

    Prokaryotická buňka (Bacillus megaterium)

 

Copyright Dr. Gary Kaiser. S laskavým svolením.

 

Buněčný obal (cell envelope, URL 219) se skládá ze dvou nebo tří vrstev: vnitřní cytoplazmatické membrány, buněčné stěny, a u některých druhů bakterií vnější mikropouzdro – kapsula.

Pouzdro, kapsula (capsule, URL 220) je třetí ochranný obal složený z různých sloučenin, většinou bílkovin a polysacharidů. Označuje se také jako glykokalyx , vnější viskózní vrstva obklopující buňku.  Kromě jiného je jeho nejdůležitější funkcí ochrana bakterie před vyschnutím a před fagocytózou většími mikroorganismy. Kapsula je také hlavní virulentní faktor u většiny nemocí způsobených bakteriemi (např. Escherichia coli a Streptococcus pneumoniae). Mutanty těchto organismů, které nemají kapsulu, nejsou virulentní a proto nezpůsobují nemoci.

 

Bezbarvé kapsule obklopující purpurově zbarvené bakterie

Copyright Dr. Gary Kaiser. S laskavým svolením.

  

Všechny bakterie vylučují nějaký druh glykokalyxu. Ten se skládá z transmembránových proteinů a na ně vázaných glycidů. Tvoří jej velké množství vzájemně propletených polysacharidových vláken vystupujících z bakterie, mezi nimiž působí elektrostatické a jiné síly. Pokud tvoří rozsáhlý, pevně propojený a k buněčné stěně přiléhající želatinový obal, označuje se jako kapsula. Pokud tvoří glykokalyx neorganizovanou a k buněčné stěně jen slaběji vázanou vrstvu, nazývá se slizová vrstva. Produkce glykokalyxu často závisí na podmínkách okolního prostředí. Z mnoha funkcí glykokalyxu jsou dvě zvláště důležité: způsobuje rezistenci bakterií vůči fagocytóze a umožňuje jim přilnout na různé povrchy (kameny, zuby).

 

Buněčná stěna (cell wall) se skládá z peptidoglykanu (mureinu), což je molekula mukopolysacharidu. Obklopuje cytoplazmatickou membránu, dává buňce její tvar a chrání ji před okolním prostředím. Pomáhá také zakotvení bičíku a fimbrií, které vycházejí z cytoplazmatické membrány a pronikají buněčnou stěnou ven. Síla buněčné stěny také chrání buňku před roztržením v případě velkých rozdílů osmotického tlaku mezi cytoplazmou a okolím.

Složení buněčné stěny je u bakterií velmi proměnné a je také důležitým faktorem umožňujícím rozdělit bakterie na dva základní druhy, gram-pozitivní a gram-negativní (URL 221). Tuto techniku, spočívající v barvení a následném vymývání preparátu, objevil dánský lékař Hans Christian Gram v roce 1884. Gram-pozitivní bakterie si zachovají nachovou barvu barviva, protože struktura jejich mohutné buněčné stěny je zachycuje na rozdíl od buněčné stěny gram-negativních bakterií, která barvivo při promytí v alkoholu či acetonu uvolňuje. Gram-negativní bakterie mají tenkou peptidoglykanovou vrstvu, nad níž je ještě membrána jiné konstrukce, ale s póry, které dovolují volný přístup molekul (vnější membrána)

 

Struktura gram-pozitivní a gram-negativní buněčné stěny

 

         

         

Struktura gram-pozitivní buněčné stěny: jeví se jako hustá vrstva složená z mnoha vrstev peptidoglykanu a molekul lipoteikoové kyseliny, na jejímž povrchu se nachází teikoová kyselina a povrchové proteiny

Struktura gram-negativní buněčné stěny: skládá se z tenké vnitřní vrstvy peptidoglykanu a z vnější membrány složené z molekul fosfolipidů, liposacharidů (LPS), lipoproteinů a povrchových proteinů.

Copyright Dr. Gary Kaiser. S laskavým svolením.

 

 

 

Cytoplazmatická membrána (cytoplasmic membrane) je dvojvrstva fosfolipidů obsahující proteiny. Reguluje tok látek mezi buňkou a jejím okolím. Jedná se o dynamický, vysoce organizovaný útvar, který se stále přizpůsobuje různým podmínkám vnějšího nebo vnitřního prostředí buňky.

Diagram cytoplazmatické membrány

Copyright Dr. Gary Kaiser (URL 222). S laskavým svolením.

 

 

Cytoplazma (cytoplasm) tvoří vlastní obsah buňky. Jedná s o matrici gelovitého charakteru složenou z vody, enzymů, živin, odpadních látek a plynů. Obsahuje buněčné struktury jako např. ribozomy a plastidy. V oblasti zvané nukleoid je lokalizován chromozom.

Jádro (nucleoid) nemá typickou podobu jako u eukaryontů. Je to oblast cytoplazmy, ve které se nachází chromozomální DNA, neohraničená membránou. Většina bakterií obsahuje jeden kruhový chromozom zodpovědný za replikaci, ačkoliv několik druhů obsahuje dva nebo i více chromozomů. V cytoplazmě se také nachází menší kruhové řetězce DNA zvané plazmidy. Jedná se o malé, mimochromozomální genetické struktury, které se nachází v mnoha druzích bakterií. Na rozdíl od chromozomů se neúčastní na reprodukci. Genetické instrukce pro zahájení a průběh buněčného dělení, nebo binárního rozdělení (binary fission), které je nejčastějším způsobem rozmnožování bakterií, nesou pouze chromozomy. Replikace plazmidů probíhá nezávisle na chromozomu. Pokud nejsou přímo nezbytné pro přežití, zdá se, že dávají bakteriím selektivní výhody.

Jsou přenášeny do jiných bakterií dvěma způsoby. U mnoha typů plazmidů se kopie přenášejí do dceřinných buněk během rozdělování buňky. Ostatní plazmidy však tvoří na buněčném povrchu struktury podobné rourkám (druh fimbrií), které při konjugaci bakterií (proces, při kterém si bakterie vyměňují genetické informace) přenášejí kopie plazmidů do jiných bakterií. Ukázalo se, že plazmidy slouží jako nástroje pro přenos určitých vlastností, jako je rezistence vůči antibiotikům a těžkým kovům, a faktory pro virulenci nezbytné pro infikování živočišných či rostlinných hostitelů. Možnost vložit do plazmidů specifické geny z nich tvoří účinný nástroj pro molekulární biologii a genetiku, zvláště v oblasti genetického inženýrství.

Bičíky (flagella, sing. flagellum) jsou vlasům podobné struktury. Nacházejí se na jednom nebo obou koncích bakterie, případně na celém povrchu. Pohybují se jako vrtule pomocí „motoru“ umístěného těsně pod cytoplazmatickou membránou, a tím pomáhají bakteriím, které je vlastní, v pohybu směrem k živinám, pryč od toxických chemikálií nebo v případě fotosyntetizujících sinic směrem ke světlu.

Struktura ukotvení bakteriálního bičíku

Copyright Dr. Gary Kaiser (URL 222). S laskavým svolením.

 

 

Fimbrie (pili, sing. pilus) jsou malé, chloupkům podobné útvary složené z proteinů. Vystupují z povrchu buňky a umožňují přichycení bakterií na jiné buňky nebo povrchy jako jsou zuby, vnitřnosti nebo skály. Bez nich mnohé patogenní bakterie ztrácejí schopnost infekce, protože se nejsou schopny přichytit k hostitelské buňce. Specializované sexuální fimbrie, umožňují při konjugaci buněk výměnu fragmentů plazmidové DNA.

Ribozomy (ribosomes) jsou mikroskopické „továrny“ nacházející se ve všech buňkách včetně prokaryontů. Překládají genetický kód z molekulárního jazyka nukleových kyselin do jazyka aminokyselin, stavebních prvků bílkovin. Bakteriální ribozomy jsou jsou podobné ribozomům eukaryontů, ale jsou menší a mají poněkud odlišné složení a molekulární strukturu. Bakteriální ribozomy se nikdy nevážou na jiné organely, jsou volně rozloženy v cytoplazmě. Mezi bakteriálními a eukaryotickými ribozomy jsou dostatečné rozdíly na to, aby některá antibiotika mohla inhibovat funkci bakteriálních ribozomů, ale nikoli eukaryotických. Mohou tedy zabíjet selektivně bakterie, ale nikoliv eukaryotické organismy.

Mesozomy (mesosomes).  V bakteriích se nacházejí váčkům nebo trubicovitým útvarům podobné membránové struktury nazývané mesozomy, tvořené zřejmě vchlípením plazmatické membrány. Elektronový mikroskop je zobrazuje jako sférické částice se strukturou podobnou ementálskému sýru. Tyto struktury se vyskytují častěji u Gram-pozitivních než u Gram-negativních organismů. Dříve se věřilo, že tvoří u bakterií cosi jako ekvivalent mitochondrií, přisuzuje se jim však mnoho dalších funkcí. V současné době neexistuje žádný uspokojivý důkaz o jejich speciální biochemické či fyziologické funkci. Studie preparátů v elektronovém mikroskopu naznačují, že mesozomy vznikají fixací artefaktů vchlípením membrány. Některá pozorování naznačují, že mesozomy mohou mít nějaký vztah k dějům souvisejícím s buněčným dělením.

Chromatofory – tylakoidy. Bakterie nemají chloroplasty. Místo nich obsahují chromatofory, což jsou membránové struktury, tvořené četnými záhyby plazmatické membrány. Chromatofory obsahují tylakoidy podobné rostlinným, které u některých bakterií obsahují chlorofyl. V těchto bakteriích probíhá fotosyntéza podobně jako u rostlin. Mnohé z nich se hojně vyskytují v oceánech, řekách a jezerech. Uvolňují kyslík, který umožňuje přežít vodním živočichům. Některé archebakterie mají odlišný typ fotosyntézy: místo vody využívají sirovodík  (URL223) a místo kyslíku uvolňují síru.

 

   

Sinice (URL 224) v elektronovém mikroskopu - na prvním snímku vlevo povrch cytoplazmatické membrány, vpravo vnitřní struktura (tylakoidy) obojí z rastrovacího elektronového mikroskopu, preparát připraven technikou mrazového leptání (freeze etching), na druhém snímku vlevo vnitřní struktura (tylakoidy, rovněž rastrovací elektronový mikroskop a freeze etching), vpravo struktura tylakoidů v prozařovacím elektronovém mikroskopu

 

 

Extrémně slanomilné halobakterie, nacházející se v solných plochách pouští, patří mezi fototrofní archea. Jejich červené membrány obsahují bakteriorodopsin, který má zcela jinou primární fotochemickou reakci než fotosyntéza založená na bakteriochlorofylu. Bakteriorodopsin se skládá z pigmentu retinalu, navázaného na membránový protein (opsin). Funguje jako jednoduché čerpadlo, které v cyklické fotochemické reakci přenáší přes membránu vodíkové ionty. Vzniklý gradient pohání enzymový komplex ATPázy, produkující ATP. Halobakterie však neprodukují glukózu. Podobný pigmentový komplex, proteorodopsin, byl nalezen i u mořských bakterií (eubakterií).

Příspěvek fotosyntetických bakterií a fototrofních archeí ke globálním tokům energie a uhlíku byl dosud považován za zanedbatelný. Poslední výzkumy však ukazují, že tento názor bude zřejmě nutno přehodnotit. (Vesmír 9, 2002, str. 505).

Granula – volutin (URL 225), bakteriální glykogen:  V cytoplazmě prokaryotických buněk se často nachází nějaký typ inkluzních granulí. Jsou to ohraničená granula, která mohou zabírat podstatnou část prostoru v cytoplazmě. Obvykle obsahují nějaký druh materiálu, například glycidy (glykogen), tuky, bílkoviny a polyfosfátová zrna (volutin). Zásoby uhlíku a energie mohou být uloženy ve formě glykogenu (polymeru glukózy). Inkluze polyfosfátu jsou zásobárnami PO4. Síru jako prvek ve formě globulí ukládají některá fototrofní prokaryota jako rezervu elektronů či litotrofní prokaryota jako zásoby energie. Některé inkluzní částice jsou ve skutečnosti membránou ohraničené měchýřky, které obsahují fotosyntetické pigmenty (bakteriofyl v chlorozomech zelených bakterií a fykobilin–proteinový (URL 226) komplex ve fykobilizomech sinic) nebo enzymy (karboxyzomy u mnoha autotrofních bakterií, kde tyto enzymy slouží jako místa pro autotrofní fixaci CO2). Některé vodní bakterie také obsahují v tzv. magnetozomech magnetit (Fe3O4), který jim slouží k orientaci při migraci podél siločár zemského magnetického pole.

 

Prokaryotické organismy se nacházejí ve všech prostředích, ve kterých je možný život. Pro růst svých buněk mají obvyklé požadavky na výživu. Mnohé z nich však používají zcela unikátní způsoby využití a transformace živin.

Prokaryotické organismy lze podle způsobu získávání energie a živin dělit:

 

1)    1)     Podle zdrojů uhlíku

               Autotrofní: Autotrofní organismy využívají jako zdroj uhlíku CO2 a energii získávají ze světla (fotoautotrofní organismy) nebo oxidací anorganických sloučenin (litoautotrofní)

               Heterotrofní: Heterotrofní organismy získávají uhlík pro růst z organických látek. Většina heterotrofních prokaryotů jsou saprofyty, což znamená že získávají živiny z mrtvých organismů. Saprofytické bakterie a houby v půdě zodpovídají za biologickou degradaci organického materiálu. Nakonec jsou organické molekuly degradovány až na CO2. Je však pravděpodobné, že organické látky, které nevznikají přirozenou cestou, nemohou být tímto způsobem degradovány.

2)    2)     Podle zdrojů energie

               Fototrofní: Fotosyntetizující prokaryota mění světelnou energii na energii chemickou, kterou využívají pro růst. Mnohé fototrofní bakterie jsou autotrofy, takže jejich role v uhlíkovém cyklu je analogická jako u rostlin.

               Chemotrofní: získávají energii oxidací redukovaných látek.

Tyto dvě skupiny fyziologických variant jsou u prokaryotů (na rozdíl od eukaryot) vzájemně kombinovatelné, takže bakterie mohou být

Organismy

Zdroj energie

Zdroj uhlíku

Fototrofní

světlo

 

  • fotoheterotrofní

světlo

organické látky

  • fotoautotrofní

světlo

CO2

Chemoorganotrofní

organické látky

 

  • chemoorganoheterotrofní

organické látky

organické látky

Chemolitotrofní

anorganické látky

 

  • chemolitoautotrofní

anorganické látky

CO2

 

 

-        -         fotoautotrofní: Většina fototrofních bakterií je autotrofních, takže jejich role v koloběhu uhlíku je analogická jako u rostlin. Do této skupiny patří prokaryotní sinice (URL 194), nacházející se také v mořském fytoplanktonu, kde svou fotosyntézou vytvářejí podstatné množství kyslíku obsaženého v biosféře.

                                                    

                                                                    Sinice a na akvarijních rostlinách (foto V. Pelikán, s laskavým svolením) (URL  58)

 

-        -         Fotoheterotrofní: Tento typ metabolismu se nevyskytuje u eukaryot, ale v oceánech existují fotosyntetické prokaryotické organismy, využívající jako zdroj energie světlo a jako zdroj uhlíku organické sloučeniny.  Patří mezi ně tzv. aerobní fototrofní bakterie (URL 193), které jsou schopny vypínat a zapínat fotosyntézu. Aby uspokojily svou potřebu metabolické energie, chovají se občas jako rostliny. Odhaduje se, že tvoří nejméně 11% všech mikrobů v blízkosti povrchu oceánů.

-        -         Chemoautotrofní (chemolitoautotrofní):  V ekosystémech hlubokomořských sopečných vývěrů (Vesmír 79, 327, 2000/6) žijí chemoautotrofní bakterie využívající různé redukované sloučeniny (Mn2+, Fe2+, H2, H2S) uvolňované z vývěrů jako hlavní zdroj energie. Tyto bakterie pak slouží jako zdroj organického uhlíku pro vyšší organismy, jako jsou například termofilní červi rodu Alvinella.

-        -         Chemoheterotrofní (chemoorganoheterotrofní): Jsou to parazitické bakterie. Některé (E. coli) žijí v zažívacím traktu zvířat. Jiné, např. Salmonella, jsou patogenní. 

 

viz URL 133

 

 

 

 

1.4.2. Eukaryotické buňky

se liší od prokaryotických buněk hlavně strukturou jádra. To vytváří samostatný kompartment, oddělený od cytoplazmy jaderným obalem. Jádro obsahuje více chromozomů. Jejich struktura je též složitější, protože se na ní podílejí – na rozdíl od prokaryotního chromozomu, uloženého volně v cytoplazmě – bílkoviny typu histonů, které vytváří spolu s DNA tzv. nukleoprotein.

Rozdíly (URL 145) mezi oběma typy buněk se však neomezují jen na buněčné jádro. Prokaryotické buňky jsou velmi chudé na membránové systémy a jsou zpravidla menší (obvykle několik mikrometrů). Také ribosomy prokaryotních buněk (tzv. 70S ribosomy) jsou menší než u buněk eukaryotních (tzv. 80S ribosomy). U prokaryotních buněk nebyly nalezeny komponenty cytoskeletu. Velmi odlišný je také mechanismus buněčného dělení.

 

Srovnání charakteristik prokaryot a eukaryot

Charakteristika

Prokaryota

Eukaryota

Organely

nepřítomny

přítomny

jádro

ne

ano

jadérko

ne

ano

Genetická informace

jediný chromosom

mnohočetné chromosomy

DNA

obnažená

spojená s proteiny

Množení buňky

dělení

mitóza a meióza

Syntéza proteinů

spřažená s transkripcí
v stejném kompartmentu

RNA se tvoří v jádře;
pak přenesena do cytoplasmy

Energetický metabolismus

anaerobní a aerobní

aerobní

Respirační enzymy

v plasmatické membráně

v mitochondriích

Buněčná stěna

přítomna

Chybí, ale je zde extracelulární matrix

Cytoskelet

ne

ano

Endocytóza nebo exocytóza

ne

ano

 

 

 

(URL 65)

 

Buňky s jádrem: Archezoa, Chromista, Protozoa, Fungi, Plantae, Animalia.

Pro studium struktury buněk je nutné barvení histologických preparátů nebo použití elektronové mikroskopie. V současnosti je mnoho možností studia na internetu. Lze použít vyhledávače (www stránky - viz seznam literatury).

 

1.4.2.1. Živočišné buňky

 

 

Živočich je heterotrofní eukaryotický mnohobuněčný organismus, v jehož vývoji se vyskytují nejméně dvě vrstvy buněk (stadium gastruly)

--                     Buňky jsou diferencovány k určitým úkolům do souborů (tkání)

--                     Tkáně mohou vytvářet orgány nebo soustavy orgánů zabezpečujících životní pochody a funkce živočicha, které spolu logicky souvicejí:

--                     Příjem a zpracování organické potravy (nutnost potravu v prostředí objevit, proto se vytvořily:)

--                     Dráždivost a orientace v prostředí (registrace potravy, partnera, nepřítele … vyžaduje:)

--                     Schopnost pohybu buď celého živočicha nebo jeho částí (Vlastnost pro živočichy charakteristická. Nepohybuje –li se živočich, pohybuje se prostředí, ve kterém žije)

--                     Vyšší nervová a duševní činnost (Není dána všem živočichům a zřejmě se nevyskytuje u jiných forem organizmů.)

--                     Složité vnitřní členění jak co do počtu buněk a jejich typů, tak i co do rozmanitosti tkání a orgánů. Povrch často jednoduchý.

--                     Schopnost reprodukce (Není výlučnou vlastností živočichů – je charakteristická pro všechny organizmy)

 

 

Mezi živočichy tedy dnes řadíme pouze organizmy mnohobuněčné. Metabolismem příbuzné živočichům jsou buňky prvoků (říše Protozoa).

Živočišné buňky, ač většinou vybaveny stejnými základními organoidy, jsou často v průběhu tzv. ontogenetického vývoje (vývoje jedince) velmi rozmanitě utvářené (diferencované) podle funkce, kterou v daných souborech buněk mají vykonávat.

Jsou různé velikosti. Krvinky člověka měří 5 -7 mikrometrů, žahavci mají některé buňky dlouhé až 100 mm, nervové buňky mají výběžky až několik m. Největší živočišná buňka je pštrosí vajíčko. Vnitřní prostor eukaryotických buněk je dělen biomembránami na celou řadu tzv. kompartmentů, čímž se rovněž liší od buněk prokaryotických.

 

                 

                                           krvinky člověka (URL 21)                                        vejce pštrosa Emu (převzato z URL 68)

 

Živočišná buňka je oddělena od okolí plazmatickou membránou. Uvnitř je metabolicky aktivní protoplazma, kterou v oblasti jádra nazýváme karyoplazmou a mimo jádro cytoplazmou. Kromě protoplazmy buňka obsahuje rozpuštěné zásobní, případně odpadní látky. Jsou-li nerozpuštěné, nazýváme je inkluze.

 

Protoplazma obsahuje cytosol (dříve základní cytoplazma), organoidy ( tj. funkční buněčné struktury, též zvané organely) a cytoskelet.

 

 

Rozdíly mezi buňkami mnohobuněčných Eukaryot:

 

Rostliny: Buněčná stěna (celulóza a pod.), vakuoly jako metabolicky aktivní membránová struktura, chloroplasty, nemají lysozomy, místo dělícího tělíska mají cytocentrum, (symplast a apoplast, diplo- nebo polyploidní). Zásobní látka - škrob.

 

Houby: buněčná stěna (chitin), vakuola, často haploidní, ale i diploidní formy existence. Zásobní látka glykogen.

 

Živočichové: Bez buněčné stěny (s výjimkami - vejce), mají centriol.

Nejsou zde metabolicky aktivní vakuoly, jen tukové či turgorové ve struně hřbetní, diploidní forma existence, zásobí látka glykogen.

stavba eukaryotické buňky

A)                                                                         B)

Stavba eukaryotické buňky (Rozsypal, 1994).

A) Schéma živočišné buňky:
a - lysozóm, b - sekreční váček, c - plazmatická membrána, d - Golgiho komplex, e - desmozóm, f - centriol,
g - endoplazmatické retikulum, h - jádro, i - jadérko, j - chromatin, k - ribozómy, l - mitochondrie, m - základní cytoplasma.


B) Schéma rostlinné buňky:
a - vakuola, b - váček, c - plazmatická membrána, d - diktyozóm (Golgiho tělísko), e - plastid, f - plazmodesm,
g - endoplazmatické retikulum, h - jádro, i - jadérko, j - chromatin, k - ribozómy, l - mitochondrie, m - základní cytoplasma, n - buněčná stěna.

 

 

 

1.5. Struktura živočišné buňky:

a) Podle tradičního dělení v buňce rozeznáváme

1. Cytosol

2. Funkční buněčné struktury

3. Buněčné inkluze

 

1.        1.          Cytosol

Cytoplazmu lze charakterizovat jako základní tekutou složku buňky, tvořenou směsí koloidních a krystaloidních roztoků anorganických a organických látek. Její hlavní funkcí je vytvářet vhodné prostředí pro činnost všech buněčných organel a výměnu látek mezi nimi. Je sklovitě průhledná, čirá, jednolomná (výjimečně dvojlomná - panožky Rhizopod), viskozita je proměnlivá podle množství koloidů a vody. Při povrchu buněk bývá její hustota vyšší a bývá v ní méně organel (hyaloplazma), uvnitř buňky bývá řidší a s větším množstvím organel (granuloplazma). Je slabě kyselé až neutrální povahy, pH kolem 6,8 (3,8 – 7,0). Z biochemických pochodů v ní probíhá částečně přeměna bílkovin, štěpení cukrů (anaerobní glykolýza aj.) a přeměna tuků. Světelná mikroskopie umožňuje rozlišit tzv. hyaloplasmu a granuloplasmu (URL 67)

Hyaloplazma – hustá, bezstrukturní, sklovitá hmota (ektoplazma), která neobsahuje organoidy.

Granuloplazma – (endoplazma) se nachází zpravidla blíže ke středu buňky, v okolí jádra, zrnitost v optickém mikroskopu je dána přítomnosti organoidů (ER, ribozomy, mitochondrie).