Student DSP absolvuje na základě individuálního studijního programu stanoveného školitelem a schváleného oborovou radou disciplíny rozdělené do 4 oddílů:
Oddíl A. Kurzy zaměřené na rozšíření znalostí vědního oboru a koncipované jako nadstavba magisterského studia. Nabídka společných předmětů pro různé dílčí obory Biologie se dynamicky mění. Zpravidla se jedná o čtyři kurzy, které studenti absolvují během prvních dvou nebo tří semestrů doktorského studia. Součástí oddílu A může být souborná zkouška. Výběr kurzů a rozhodnutí o zařazení nebo nezařazení souborné zkoušky jsou v pravomoci příslušné oborové komise na návrh školitele.
Oddíl B. Kurzy prohlubující znalosti specializovaných partií oboru ve vazbě k tématu disertační práce. Přednášky a cvičení v tomto oddílu zapisují studenti DSP podle pokynů školitele a vlastního zájmu minimálně v rozsahu uvedeném v tabulce hodinového rozpisu.
Oddíl C. Odborné semináře; minimální hodinový rozsah oddílu B + C činí dvě hodiny týdně ve čtvrtém, pátém a šestém semestru studia.
Oddíl D. Pomoc při zajišťování praktické výuky v pregraduálním studiu; cvičení, semináře, praktika apod., minimálně dvě vyučovací hodiny týdně v průběhu 1. - 6. semestru.
Specifikace způsobu ukončení kurzů oddílů A, B a C, eventuálně doplňujících kurzů, z nichž jsou předepsány povinné zkoušky, jsou součástí individuálního studijního plánu. Předměty oddílu D jsou ukončeny zápočtem. Plnění povinností stanovených individuálním studijním programem je příslušným oddělením děkanátu kontrolováno po ukončení akademického roku.

Předepsané minimální počty hodin pro jednotlivé oddíly:

Semestr	Oddíl A	Oddíl B	Oddíl C	Oddíl D
1.	2	2	2	2-4
2.	2	2	2	2-4
3.	-	2	2	2-4
4.	-	2	2	2-4
5.	-	2	2	2
6.	-	2	2	2