Již od třicátých let 20. století je známo, že existují dva morfologicky výrazně odlišné typy orchideoidní mykorhizy, tolypofágie a ptyofágie (Burgeff 1936) (viz obrázek).Vnitrokořenovou strukturou typickou pro tolypofágní orchideoidní mykorhizu jsou tzv. klubíčka hyf (viz obrázky klubíček hyf v kořenech fotosynteticky aktivního druhu Platanthera chlorantha a v nezeleném plně mykoheterotrofním druhu Neottia nidus-avis). Vyvíjejí se uvnitř buněk primární kůry kořene, kde se hyfa penetrující dovnitř buňky větví a vytváří hustou spletenou strukturu, přičemž houba posléze prorůstá do buňky sousední. Toto prorůstání dovnitř buněk kořene neznamená, stejně jako v případě AM či erikoidní mykorhizy, že dochází k přímému kontaktu s cytoplazmou rostlinné buňky. Penetrující hyfa je ve svém vývoji v klubíčko postupně obalována vchlípenou cytoplazmatickou membránou hostitelské buňky. Takto vytvořené klubíčko ovšem po určité době kolabuje, přičemž příčiny tohoto procesu nejsou prozatím známy. Z původně vysoce členitého útvaru s velkým vzájemným povrchem s hostitelskou buňkou se stává shluk amorfní houbové tkáně. Buňka, u níž došlo ke kolapsu klubíčka (označovaná jako fagocyt) může být znovu rekolonizována novým hyfovým klubíčkem. Klubíčka hyf se však nerozrůstají v celé primární kůře kořene. Hlubší vrstvy primární kůry obsahujíc škrob, které označujeme jako zásobní buňky, nebývají houbou kolonizovány. Rovněž tak nebývají infikovány buňky endodermis a pletiva středního válce (viz průřez mykorhizním kořenem Neottia nidus-avis.
U ptyofágního typu OM dochází rovněž ke kolonizaci buněk primární kůry. Rhizomorfa nasedá na kořen a jednotlivé hyfy prorůstají kořenem. V hlubších vrstvách kortexu pak dochází k obdobnému procesu jaký nacházíme u monotropoidní mykorhizy: hyfa, která penetrovala kortikální buňku na vrcholu "praská" a uvolňuje svůj obsah, postupně obalovaný plazmalemou hostitelské buňky, do cytoplazmy této buňky. Protože však i v případě ptyofágního typu Om se tvoří hustá klubíčka hyf, je možné, že to co považujeme za odlišný (ptyofágní) typ OM je pouze manifestací obrany orchideje pro potencionálně parazitické václavce, zatímco "mykorhizní" fungování zabezpečují i zde tolypofágní klubíčka hyf.