Mgr. Bc. Jana Porubská

odborná pracovnice – Sdílená laboratoř Správa a analýza biologických dat

e‑mail:

sociální a akademické sítě:

Základní údaje

Životopis

Školitel

Kvalifikace

Publikace

Druh

Počet publikací: 8

2025

AlphaFind 2.0 – Enhanced structural similarity search for AlphaFold database

SLANINÁKOVÁ Terézia ČILLÍK Jakub ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína KŘENEK Aleš PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

Další prezentace na konferencích

Rok: 2025, druh: Další prezentace na konferencích

2024

AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

GREŠOVÁ Katarína ŠPRINGEROVÁ Pavlína SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Konferenční abstrakty

Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty
AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína ČILLÍK Jakub JÁNOŠOVÁ Miriama PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Konferenční abstrakty

Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty
AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome

PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Výzkumná zpráva

Rok: 2024
AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Článek v odborném periodiku

Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: W1, DOI
Rare ring conformations in PDB: Facts or wishful thinking?

BUČEKOVÁ Gabriela DOSHCHENKO Viktoriia CHARESHNEU Aliaksei PORUBSKÁ Jana PAJTINKA Michal OLEKSIK Michal SVOBODA Tomáš HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ Radka

Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

Rok: 2024, druh: Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

2023

Exploring the relationship between structural quality and journal impact factor

PORUBSKÁ Jana HORSKÁ Veronika HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ Radka

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
Journal metrics and structures: A dynamic interplay

PORUBSKÁ Jana HORSKÁ Veronika HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ Radka

Konferenční abstrakty

Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

Projekty

Výuka