Informace o projektu
Evoluce holocentrických chromosomů (EvoHolo)

Kód projektu

GA13-29362S

Období řešení

1/2013 - 12/2016

Investor / Programový rámec / typ projektu

Grantová agentura ČR

Standardní projekty

Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Adaptivní vznik holocentrických chromosomu (bez lokalizované centromery) jako obrany proti centromerickému tahu bude testován pomocí selekcních režimu pusobících na geny kinetochorových proteinu. K objasnení prekvapive negativní korelace 2C/2n a znacné divergence velikostí a poctu holocentrických chromosomu je navržen nový evolucní mechanismus "holokinetický tah", který bude testován analýzou segregace fragmentovaných/nefragmentovaných homologu v potomstvu strukturálních heterozygotu pripravených rentgenovým zárením. Velikost genomu a genomický obsah GC, proporce a efektivita jednotlivých mechanismu karyotypové evoluce (aneuploidie, polyploidie, fúze/fragmentace chromosomu, proliferace/odstranování repetitivní DNA) budou analyzovány v holocentrických (Cyperaceae+Juncaceae, Chionographideae, Cuscuta subg. Cuscuta a Grammica, Drosera) a jejich sesterských monocentrických liniích pomocí prutokové cytometrie, pocítání chromosomu a nove vyvinutého fylogentického algoritmu. Bude vyvinuta nová detekcní technika pro masívní skríning holocentrismu u rostlin kombinující zárení a cytometrii.

Publikace

Počet publikací: 9

2017

Evolution of genome size and genomic GC content in carnivorous holokinetics (Droseraceae)

VELEBA Adam ŠMARDA Petr ZEDEK František HOROVÁ Lucie ŠMERDA Jakub BUREŠ Petr

Článek v odborném periodiku

Annals of Botany, rok: 2017, ročník: 119, vydání: 1, DOI

2016

Absence of positive selection on CenH3 in Luzula suggests that holokinetic chromosomes may suppress centromere drive

ZEDEK František BUREŠ Petr

Článek v odborném periodiku

Annals of Botany, rok: 2016, ročník: 118, vydání: 7, DOI
CenH3 evolution reflects meiotic symmetry as predicted by the centromere drive model

ZEDEK František BUREŠ Petr

Článek v odborném periodiku

Scientific Reports, rok: 2016, ročník: 6, vydání: September, DOI
Flow cytometry may allow microscope-independent detection of holocentric chromosomes in plants

ZEDEK František VESELÝ Pavel HOROVÁ Lucie BUREŠ Petr

Článek v odborném periodiku

Scientific Reports, rok: 2016, ročník: 6, vydání: June, DOI

2014

Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots

ŠMARDA Petr BUREŠ Petr HOROVÁ Lucie LEITCH Ilia J MUCINA Ladislav PACINI Ettore TICHÝ Lubomír GRULICH Vít ROTREKLOVÁ Olga

Článek v odborném periodiku

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, rok: 2014, ročník: 111, vydání: 39, DOI
Genome size and genomic GC content evolution in the miniature genome-sized family Lentibulariaceae

VELEBA Adam BUREŠ Petr ADAMEC Lubomír ŠMARDA Petr LIPNEROVÁ Ivana HOROVÁ Lucie

Článek v odborném periodiku

New Phytologist, rok: 2014, ročník: 203, vydání: 1, DOI

2013

Holokinetic Drive in the Karyotype Evolution of Monocots

ZEDEK František BUREŠ Petr

Konferenční abstrakty

Rok: 2013, druh: Konferenční abstrakty
Nutrient reserves may allow for genome size increase: evidence from comparison of geophytes and their sister non-geophytic relatives

VESELÝ Pavel BUREŠ Petr ŠMARDA Petr

Článek v odborném periodiku

Annals of Botany, rok: 2013, ročník: 112, vydání: 6, DOI
The Evolution of Genome Size and Base Composition in Cyperid Clade

BUREŠ Petr MUASYA Abraham Muthama LIPNEROVÁ Ivana ZEDEK František BAUTERS Kenneth ŠMARDA Petr VILJOEN Jan-Adriaan GONZALEZ ELIZONDO Maria Socorro BARRETT Russell GOETGHEBEUR Paul BRUHL Jeremy MWACHALA Geottrey PRYCHID Christina HROUDOVÁ Zdena THOMAS Wayt WILSON Karen

Vyžádané přednášky

Rok: 2013, druh: Vyžádané přednášky