Informace o projektu
Strukturní podstata pro opětovné sestavení nukleosomu při přepisu genu zrostředkovaná proteinem Spt6
- Kód projektu
- GA22-19896S
- Období řešení
- 1/2022 - 12/2024
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Elongační faktor Spt6 interaguje s RNA polymerázou II (Pol II) a působí jako histonový chaperon, který podporuje opětovné sestavení nukleosomů po průchodu polymerázy. Přesný mechanismus opětovného sestavení nukleosomů zprostředkovaný faktorem Spt6 zůstává nejasný. Navrhujeme studovat opětovné sestavení nukleosomů zprostředkované Spt6 kombinací kryoelektronové mikroskopie (kryo-EM) a biochemických přístupů. Budeme zkoumat strukturní podstatu autoinhibice a aktivace faktoru Spt6, který je zprostředkován jeho N-terminální oblastí a dále jak Spt6 interaguje s histony a nukleosomem. Dále budeme studovat v definovaném biochemickém systému, jak Spt6 spolupracuje s dalšími elongačními faktory Spt4/5 a Pol II, což vede účinnému sestavení nukleosomů, a také určíme strukturu transkripčního komplexu Pol II–Spt4/5–nukleosom navázaným na Spt6 pomocí kryo-EM. Naše studie odhalí roli důležitosti spolupráce mezi vnitřně neuspořádanými a strukturovanými oblastmi Spt6, které regulují vazbu na nukleosom a Pol II, a opětovné sestavení nukleosomů.