Mgr. Tibor Botka, Ph.D.

Životopis

Identifikace osoby

• Mgr. Tibor Botka, Ph.D.

Pracoviště

• Masarykova univerzita
  Přírodovědecká fakulta
  Ústav experimentální biologie
  Laboratoř molekulární diagnostiky mikroorganismů
  Kamenice 5, 625 00 Brno
  

Funkce na pracovišti

• odborný asistent

Vzdělání

• 2017: Ph.D. (PřF MU, Molekulární a buněčná biologie)
  
• 2013: Mgr. (PřF MU, Molekulární biologie a genetika)
  
• 2011: Bc. (PřF MU, Molekulární biologie a genetika)

Předchozí zaměstnání

• 2013-2018 odborný pracovník (PřF MU, ÚEB)

Pedagogická činnost

• Molekulární biologie virů
• Praktikum z molekulární biologie virů
• Praktikum z molekulární biologie
• Laboratorní cvičení z molekulární biologie pro biochemiky
• Specializační seminář Molekulární biologie a genetika
• Laboratorní seminář Oddělení genetiky a molekulární biologie
• Vedoucí, konzultant a oponent bakalářských a diplomovych prací

Vědeckovýzkumná činnost

• řešitel:
  Grant EMBO (EMBO9572): Interactions between therapeutic staphylococcal phages and their hosts in bacterial communities and consequences for phage-antibiotic synergy (PAS)
  Grant AZV MZ ČR (NU21J-05-00035): Synergy of lytic bacteriophages and antibiotics in the therapy of topical infections of Staphylococcus aureus
  Grant FRMU (MUNI/FR/1181/2018): Inovace metod v Praktiku z molekulární biologie virů
  
• člen řešitelského týmu:
  Projekt Národní institut virologie a bakteriologie (LX22NPO5103)
  Grant Ga ČR (GA18-13064S): Analýza interakcí mezi polyvalentním terapeutickým fágem druhu Twort-like a jeho hostitelem Staphylococcus aureus
  Grant MZe ČR (QJ1510216): Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat
  
• podíl na řešení:
  Grant MZ ČR (NT12395-5): Molekulární průkaz a analýza invazivních kmenů small colony variants (SCV) a rezistentních kmenů S. aureus od pacientů s cystickou fibrózou
  Grant MŠMT (ED0006/01/01): Centrum pro aplikovanou mikrobiologii a imunologii ve veterinární medicíně
  Grant Ga ČR (GBP206/12/G151): Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice
  Grant MŠMT ČR (ED1.1.00/02.0068): CEITEC - central european institute of technology
  Projekt CEB, MŠMT OPVK (CZ.1.07/2.3.00/20.0183): Centrum experimentální biomedicíny
  

Akademické stáže, studijní nebo pracovní pobyty

• 28. 8. 2023 – 28. 9. 2023: University of Helsinki, Helsinki, Ostatní, FIN
  • Výzkumný pobyt na University of Helsinki s cílem navázání dlouhodobé spolupráce.
  • LX22NPO5103
• 18. 7. 2022 – 2. 9. 2022: University of York, York, Ostatní, GBR
  • Vědecko-výzkumný pobyt s cílem navázat spolupráci s eko-evoluční laboratoří dr. Ville Frimana, která se zabývá vztahy fágů a jejich hostitelů, zejména rodu Pseudomonas. Laboratoř využívá celou řadu přístupů (např. využití speciálního média pro syntetický model cystické fibrózy), přičemž cílem bylo přenést tyto postupy a znalosti do domovské laboratoře (projekt EMBO9572) a využít je ve stávajících projektech zabývajících se studiem stafylokoků a jejich fágů, a to se zaměřením na vliv antibiotik na systém fág-hostitel s cílem terapeutického využití synergie (projekt NU21J-05-00035).
  • EMBO9572, NU21J-05-00035

Mimouniverzitní aktivity

• člen American Society for Microbiology
  
• člen Československé společnosti mikrobiologické
  
• člen Genetické společnosti Gregora Mendela
  
• člen The International Society for Viruses of Microorganisms

Vybrané publikace

• DVOŘÁK, Pavel, Barbora BURÝŠKOVÁ, Barbora POPELÁŘOVÁ, Birgitta E. EBERT, Tibor BOTKA, Dalimil BUJDOŠ, Alberto SÁNCHEZ-PASCUALA, Hannah SCHÖTTLER, Heiko HAYEN, Víctor DE LORENZO, Lars M. BLANK a Martin BENEŠÍK. Synthetically-primed adaptation of Pseudomonas putida to a non-native substrate D-xylose. Nature Communications. Nature Portfolio, roč. 15, March 2024, s. 1-18. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-024-46812-9. 2024. URL info
• KUNTOVÁ, Lucie, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Radka OBOŘILOVÁ, Hana ŠIMEČKOVÁ, Adéla FINSTRLOVÁ, Pavol BÁRDY, Marta ŠIBOROVÁ, Liudmyla TROIANOVSKA, Tibor BOTKA, Petr GINTAR, Ondrej ŠEDO, Zdeněk FARKA, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus aureus Prophage-Encoded Protein Causes Abortive Infection and Provides Population Immunity against Kayviruses. mBio. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, roč. 14, č. 2, s. 1-15. ISSN 2150-7511. doi:10.1128/mbio.02490-22. 2023. Publisher info
• KOVAŘOVIC, Vojtěch, Adéla FINSTRLOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Pavel ŠVEC, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Meina NEUMANN-SCHAAL, Ondrej ŠEDO, Tibor BOTKA, Eva STAŇKOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus brunensis sp. nov. isolated from human clinical specimens with a staphylococcal cassette chromosome-related genomic island outside of the rlmH gene bearing the ccrDE recombinase gene complex. Microbiology Spectrum. Washington, DC: American Society for Microbiology, roč. 11, č. 5, s. 1-22. ISSN 2165-0497. doi:10.1128/spectrum.01342-23. 2023. URL info
• FIŠAROVÁ, Lenka, Tibor BOTKA, Xin DU, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Pavol BÁRDY, Roman PANTŮČEK, Martin BENEŠÍK, Pavel ROUDNICKÝ, Volker WINSTEL, Jesper LARSEN, Ralf ROSENSTEIN, Andreas PESCHEL a Jiří DOŠKAŘ. Staphylococcus epidermidis Phages Transduce Antimicrobial Resistance Plasmids and Mobilize Chromosomal Islands. mSphere. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, roč. 6, č. 3, s. 1-19. ISSN 2379-5042. doi:10.1128/mSphere.00223-21. 2021. URL info
• FIŠAROVÁ, Lenka, Roman PANTŮČEK, Tibor BOTKA a Jiří DOŠKAŘ. Variability of resistance plasmids in coagulase-negative staphylococci and their importance as a reservoir of antimicrobial resistance. Research in Microbiology. Amsterdam: Elsevier Science, roč. 170, č. 2, s. 105-111. ISSN 0923-2508. doi:10.1016/j.resmic.2018.11.004. 2019. Full Text info
• BOTKA, Tibor, Roman PANTŮČEK, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Martin BENEŠÍK, Petr PETRÁŠ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Pavla HAVLÍČKOVÁ, Marian VARGA, Helena ŽEMLIČKOVÁ, Ivana KOLÁČKOVÁ, Martina FLORIANOVÁ, Vladislav JAKUBŮ, Renata KARPÍŠKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Lytic and genomic properties of spontaneous host-range Kayvirus mutants prove their suitability for upgrading phage therapeutics against staphylococci. Scientific Reports. London: Nature Publishing Group, roč. 9, č. 1, s. 5475-5486. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-019-41868-w. 2019. URL info
• DOŠKAŘ, Jiří, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Martin BENEŠÍK, Tibor BOTKA, Marcela KLIMEŠOVÁ, Renáta KARPÍŠKOVÁ a Ivana KOLÁČKOVÁ. Příprava purifikovaného fága S. aureus pro použití ve veterinární praxi. 2018. Příprava purifikovaného fága Staphylococcus aureus pro použití ve veterinární praxi (STAF1) info
• BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Two highly divergent lineages of exfoliative toxin B-encoding plasmids revealed in impetigo strains of Staphylococcus aureus. International Journal of Medical Microbiology. Jena: ELSEVIER GMBH, URBAN & FISCHER VERLAG, roč. 307, č. 6, s. 291-296. ISSN 1438-4221. doi:10.1016/j.ijmm.2017.05.005. 2017. URL info
• TKADLEC, Jan, Eva VAŘEKOVÁ, Roman PANTŮČEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Tibor BOTKA, Libor FILA a Oto MELTER. Characterization of Staphylococcus aureus strains isolated from Czech cystic fibrosis patients: high rate of ribosomal mutation conferring resistance to MLSB antibiotics as a result of long-term and low-dose azithromycin treatment. Microbial Drug Resistance. New Rochelle, NY, USA: Mary Ann Liebert Inc., roč. 21, č. 4, s. 416-423. ISSN 1076-6294. doi:10.1089/mdr.2014.0276. 2015. URL info
• BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Ivan RYCHLÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ. Complete genome analysis of two new bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus. Virus Genes. Springer US, roč. 51, č. 1, s. 122-131. ISSN 0920-8569. doi:10.1007/s11262-015-1223-8. 2015. URL info

12. 6. 2023