Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales

Informace

Projekt nespadá pod Přírodovědeckou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Logo poskytovatele
Kód projektu
GA17-09644S
Období řešení
1/2017 - 12/2019
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracující organizace
Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.

V r. 2016 jsme identifikovali neobvyklé telomery u rostlin rodu Allium. Společně s našimi předchozími výsledky je nyní jasné, že během evoluce rostlin řádu Asparagales došlo ke dvěma změnám telomer: při první, spojené s divergencí rodu Iris, byly typické rostlinné telomery (TTTAGGG)n nahrazeny telomerami (TTAGGG)n typickými pro obratlovce. Ke druhé změně - z (TTAGGG)n na (CTCGGTTATGGG)n - došlo při divergenci rodu Allium. Cílem projektu je objasnit molekulární podstatu těchto tranzicí: změny v RNA podjednotkách telomeráz a v jejich interakcích s katalytickými podjednotkami, a dále zjistit dopad těchto změn na nukleoproteinové složení a na funkci telomer, která závisí hlavně na telomer-vazebných proteinech. RNA-Seq data budou získána z obohacených frakcí telomerázy a z celkového transkriptomu s cílem identifikovat RNA podjednotky telomeráz, resp. kandidátní telomer-vazebné proteiny. Interakce proteinů se současnými a ancestrálními telomerovými DNA budou testovány kvantitativními
přístupy. Projekt zlepší chápání strukturně-funkčních vztahů telomer a role telomer ve speciaci.

Publikace

Počet publikací: 4


Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.