Project information
Struktura a dynamika biopolymerů
- Project Identification
- MUNI/A/1310/2014
- Project Period
- 1/2015 - 12/2015
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Category A
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Mgr. Marek Bartošovič, Ph.D.
- Sophia Bazzi, M.Sc.
- Mgr. Lukáš Bednařík
- Mgr. Ivana Cavallin, Ph.D.
- Mgr. Matúš Durec, Ph.D.
- doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
- Cina Foroutannejad, Ph.D.
- Mgr. Veronika Horáčková, Ph.D.
- Mgr. Josef Houser, Ph.D.
- Mgr. David Kovář, Ph.D.
- doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
- Mgr. Martin Kříž
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.
- Mgr. Martin Novák, Ph.D.
- Mgr. Šárka Novotná
- Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
- prof. RNDr. Petr Skládal, CSc.
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D.
- prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. Dagmar Zigáčková, Ph.D.
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Projekt Struktura a dynamika biopolymerů je zaměřen na podporu studentský projektů v oblasti strukturní biologie. Cílem těchto projektů je propojení informací o 3D strukturách velkých biologicky aktivních makromolekulárních látek (zejména proteinů, nukleových kyselin a jejich funkčních komplexů) dohromady s informacemi o jejich vlastnostech i biologických rolích. Výsledkem je následně komplexní popis zajímavých biologických procesů, jichž se tyto makromolekuly účastní na buněčné úrovni. Plánované experimenty jsou navzájem komplementární svým rozsahem prostorového i časového rozlišení a zahrnují metody rentgenové difrakce monokrystalů, nukleární magnetickou rezonanci (NMR), mikroskopii atomových sil (AFM) doplněné o metody poskytující informace o mezimolekulárních interakcích. Studie jsou navrženy tak, aby vedly k pochopení základních principů fungování molekul v živých organizmech. Často se opírají o in-vitro systematické experimenty za využití celé škály biofyzikálních nástrojů, doplněné o teoretické studie postavené na výpočetní chemii, chemo- a bioinformatice. Detailní zájem je věnován časovým změnám třírozměrných struktur na škále pokrývající rozsah od 10E-10 do 10E-2 s, čímž získáme ucelený obraz o dynamice klíčových buněčných komponent. Část projektu je taktéž zaměřena na nových metod strukturní biologie a zpracování získaných dat pro biochemické, biomedicínské a biotechnologické aplikace. Řešení jednotlivých cílů projektů se budou standardně účastnit studenti magisterských a doktorských studijních programů garantovanými Národním centrem pro výzkum biomolekul (zejména Biomolekulární chemie) ale i ostatních oborů, na jejichž vzdělávání se NCBR podílí.
Publications
Total number of publications: 1