Rod Boechera (Brassicaceae) zahrnuje diploidní sexuálně se rozmnožující druhy, stejně jako allodiploidní a allotriploidní apomikty. U apomiktických rostlin byly popsány heterochromatické chromozomy spojené s apomixí. Díky svému malému genomu, blízké evoluční příbuznosti s huseníčkem a přirozeně se vyskytujícím diploidním sexuálním a diploidním apomiktickým liniím představuje rod Boechera jedinečný modelový systém pro studium genomických změn spojených s apomixií. Pokročilé sekvenování dlouhého čtení společně s novými algoritmy sestavování genomových sekvencí, umožňují telomere-to-telomere sekvenování, včetně čtení komplexních (peri)centromerických oblastí. Navrhujeme analyzovat Boechera genomy s použitím sekvenování dlouhých čtení, doplněné o cytogenomické a epigenetické analýzy, s cílem pochopení vztahů mezi hybridizací, reorganizací chromozomů a evolucí apomixie. Tento projekt prohloubí naše poznání o genomické struktuře a evoluční dynamice apomiktických genomů v rodu Boechera. To položí základ pro pochopení obecných molekulárních mechanismů vedoucích k expresi apomixie.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Publications