Mgr. Naděžda Špačková, Ph.D.

2003

• Conformational Flexibility of DNA sequences studied by Advanced Molecular Mechanics and Dynamics Tools

  FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Jiří KOČA Jaroslav

  Článek ve sborníku

  Book of Abstracts, rok: 2003

• Formation Pathways of a Guanine-Quadruplex DNA Revealed by Molecular Dynamics and Thermodynamics Analysis of the Substates

  ŠTEFL Richard CHEATHAM Thomas E. ŠPAČKOVÁ Naděžda FADRNÁ Eva BERGER Imre KOČA Jaroslav ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2003, ročník: 85, vydání: 3

• Molecular Dynamics of Guanine Quadruplex Molecules

  ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠTEFL Richard BERGER Imre FADRNÁ Eva KOČA Jaroslav CHEATHAM III T.E. ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Book of Abstracts, rok: 2003

• Molecular dynamics simulations of RNA kissing loop motifs reveal structural dynamics and formation of cation-binding pockets

  RÉBLOVÁ Kamila ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Judit KOČA Jaroslav ŠPONER Jiři

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2003, ročník: 31, vydání: 23

• Non-Watson-Crick Base Pairing and Hydration in RNA motifs: Molecular Dynamics of 5S rRNA Loop E

  RÉBLOVÁ Kamila ŠPAČKOVÁ Naděžda KOČA Jaroslav LEONTIS Neocles ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, rok: 2003

• Non-Watson-Crick Basepairing and Hydration in RNA Motifs:

  RÉBLOVÁ Kamila SPACKOVÁ Nadezda STEFL Richard CSASZAR Kristina KOCA Jaroslav LEONTIS Neocles SPONER Jiri

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2003, ročník: 84, vydání: 6

• Structure and Dynamics of RNA K-turn Motifs

  RÁZGA Filip ŠPAČKOVÁ Naděžda RÉBLOVÁ Kamila KOČA Jaroslav ŠPONER Jiří LEONTIS Neocles, B.

  Článek ve sborníku

  RNA klub, rok: 2003

2002

• Computer modelling of DNA quadruplex conformational behavior

  FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Jiří KOČA Jaroslav

  Článek ve sborníku

  Chemické Listy, rok: 2002

• DNA quadruplexes with lateral loops - molecular modelling study of conformational behavior

  FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Jiří KOČA Jaroslav

  Článek ve sborníku

  Chemometrics VI, rok: 2002

• Molecular dynamics of the 5S rRNA loop E

  RÉBLOVÁ Kamila ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠTEFL Richard CSASZAR Kristina KOČA Jaroslav LEONTIS Neocles ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Chemometrics, rok: 2002