prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.

2017

• Catalytic Cycle of Haloalkane Dehalogenases Toward Unnatural Substrates Explored by Computational Modeling

  MARQUES Sérgio Manuel DUNAJOVÁ Zuzana PROKOP Zbyněk CHALOUPKOVÁ Radka BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, rok: 2017, ročník: 57, vydání: 8, DOI

• Different Structural Origins of the Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases toward Linear beta-Haloalkanes: Open–Solvated versus Occluded–Desolvated Active Sites

  LIŠKOVÁ Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ Veronika BEDNÁŘ David BREZOVSKÝ Jan PROKOP Zbyněk CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Angewandte Chemie International Edition, rok: 2017, ročník: 56, vydání: 17, DOI

• Enzyme Tunnels and Gates As Relevant Targets in Drug Design

  MARQUES Sérgio Manuel DANIEL Lukáš BURYŠKA Tomáš PROKOP Zbyněk BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  MEDICINAL RESEARCH REVIEWS, rok: 2017, ročník: 37, vydání: 5, DOI

• Exploration of Protein Unfolding by Modelling Calorimetry Data from Reheating

  MAZURENKO Stanislav KUNKA Antonín BEERENS Koen JOHNSON Christopher M. DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Scientific Reports, rok: 2017, ročník: 7, vydání: November, DOI

• FireProt 1.0

  MUSIL Miloš ŠTOURAČ Jan BENDL Jaroslav BREZOVSKÝ Jan PROKOP Zbyněk ZENDULKA J. MARTÍNEK Tomáš BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří

  Software

  Rok: 2017

• FireProt: Web Server for Automated Design of Thermostable Proteins

  MUSIL Miloš ŠTOURAČ Jan BENDL Jaroslav BREZOVSKÝ Jan PROKOP Zbyněk ZENDULKA Jaroslav MARTÍNEK Tomáš BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2017, ročník: 45, vydání: W1, DOI

• High-throughput screening of haloalkane dehalogenase libraries based on a pH- sensitive assay using droplet-based microfluidics

  CHIU Flora W. Y. KOVÁŘ David STAVRAKIS Stavros BERGER Simon DEMELLO Andrew J. PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• Kinetics of Binding of Fluorescent Ligands to Enzymes with Engineered Access Tunnels

  KAUSHIK Shubhangi PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří CHALOUPKOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  FEBS Journal, rok: 2017, ročník: 284, vydání: 1, DOI

• Metagenome-derived Haloalkane Dehalogenases with Novel Catalytic Properties

  KOTÍK Martin VAŇÁČEK Pavel KUNKA Antonín PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, rok: 2017, ročník: 101, vydání: 16, DOI

• Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets

  MAZURENKO Stanislav DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek ve sborníku

  11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, rok: 2017