2016

• Synergy between NMR measurements and MD simulations of protein/RNA complexes: application to the RRMs, the most common RNA recognition motifs

  KREPL Miroslav CLERY Antoine BLATTER Markus ALLAIN Frederic H. T. ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2016, ročník: 44, vydání: 13, DOI

• TiO2-catalyzed synthesis of sugars from formaldehyde in extraterrestrial impacts on the early Earth

  CIVIŠ Svatopluk SZABLA Rafal Kazimierz SZYJA Bartłomiej M. SMYKOWSKI Daniel IVANEK Ondřej KNÍŽEK Antonín KUBELÍK Petr ŠPONER Jiří FERUS Martin ŠPONEROVÁ Judit

  Článek v odborném periodiku

  Scientific Reports, rok: 2016, ročník: 6, vydání: March, DOI

• Ultrafast excited-state dynamics of isocytosine

  SZABLA Rafal Kazimierz GORA Robert W. ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Physical Chemistry Chemical Physics, rok: 2016, ročník: 18, vydání: 30, DOI

2015

• A G-quadruplex-binding compound showing anti-tumour activity in an in vivo model for pancreatic cancer

  OHNMACHT Stephan A. MARCHETTI Chiara GUNARATNAM Mekala BESSER Rachael J. HAIDER Shozeb M. DI VITA Gloria LOWE Helen L. MELLINAS-GOMEZ Maria DIOCOU Seckou ROBSON Mathew ŠPONER Jiří ISLAM Barira PEDLEY R. Barbara HARTLEY John A. NEIDLE Stephen

  Článek v odborném periodiku

  Scientific Reports, rok: 2015, ročník: 5, vydání: june, DOI

• Can We Execute Stable Microsecond-Scale Atomistic Simulations of Protein-RNA Complexes?

  KREPL Miroslav HAVRILA Marek STADLBAUER Petr BANÁŠ Pavel OTYEPKA Michal PASULKA Josef ŠTEFL Richard ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2015, ročník: 11, vydání: 3, DOI

• Conformational dynamics of bacterial and human cytoplasmic models of the ribosomal A-site

  PANECKA Joanna ŠPONER Jiří TRYLSKA Joanna

  Článek v odborném periodiku

  Biochimie, rok: 2015, ročník: 112, vydání: May, DOI

• Electron-Driven Proton Transfer Along H2O Wires Enables Photorelaxation of pi sigma* States in Chromophore-Water Clusters

  SZABLA Rafal Kazimierz ŠPONER Jiří GORA Robert W.

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Physical Chemistry Letters, rok: 2015, ročník: 6, vydání: 8, DOI

• Excited-state hydrogen atom abstraction initiates the photochemistry of beta-2 '-deoxycytidine

  SZABLA Rafal Kazimierz CAMPOS Jesus ŠPONEROVÁ Judit ŠPONER Jiří GORA Robert W. SUTHERLAND John D.

  Článek v odborném periodiku

  CHEMICAL SCIENCE, rok: 2015, ročník: 6, vydání: 3, DOI

• Extended molecular dynamics of a c-kit promoter quadruplex

  ISLAM Barira STADLBAUER Petr KREPL Miroslav KOČA Jaroslav NEIDLE Stephen HAIDER Shozeb ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2015, ročník: 43, vydání: 18, DOI

• Hairpins participating in folding of human telomeric sequence quadruplexes studied by standard and T-REMD simulations

  STADLBAUER Petr KUHROVÁ Petra BANÁŠ Pavel KOČA Jaroslav BUSSI Giovanni TRANTÍREK Lukáš OTYEPKA Michal ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2015, ročník: 43, vydání: 20, DOI