doc. Mgr. David Bednář, Ph.D.

2024

• Stabilní lidský fibroblastový růstový faktor 9 (FGF9-STAB)

  VILÍM Jan GHAZALOVÁ Tereza IKRÉNYIOVÁ Tereza KUTALKOVÁ Kateřina BEDNÁŘ David

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

• Successor Sequence Predictor (SSP)

  KHAN Rayyan Tariq KOHOUT Pavel MUSIL Miloš ROSÍNSKÁ Monika DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David VILÍM Jan

  Software

  Rok: 2024

• Upravená dehalogenáza LinB116 se zlepšenou termostabilitou

  HAVLÁSEK Martin DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

• Variační nástroj založený na autoenkodéru pro návrh ancestrálních proteinů

  KOHOUT Pavel DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Software

  Rok: 2024

2023

• Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning

  KUNKA Antonín MARQUES Sérgio Manuel HAVLÁSEK Martin VAŠINA Michal VELÁTOVÁ Nikola CENGELOVÁ Lucia KOVÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2023, ročník: 13, vydání: 19, DOI

• Atypical homodimerization revealed by the structure of the (S)-enantioselective haloalkane dehalogenase DmmarA from Mycobacterium marinum

  ŠNAJDAROVÁ Karolína MARQUES Sérgio Manuel DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Acta Crystallographica Section D: Structural Biology, rok: 2023, ročník: 79, vydání: November, DOI

• Catalytic mechanism for Renilla-type luciferases

  SMITH Andrea TOUL Martin PLUSKAL Daniel BAATALLAH Racha GAGNOT Glwadys RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SANTANA Vinicius T. T. STUCHLÁ Markéta NEUGEBAUER Petr CHAIYEN Pimchai DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David JANIN Yves L. L. PROKOP Zbyněk MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Nature Catalysis, rok: 2023, ročník: 6, vydání: 1, DOI

• Comparison of Fungal Thermophilic and Mesophilic Catalase-Peroxidases for Their Antioxidative Properties

  POLJOVKA Andrej MUSIL Miloš BEDNÁŘ David CHOVANOVA Katarina BAUEROVA-HLINKOVA Vladena BELLOVA Jana KOHUTOVA Lenka BARATH Peter ZAMOCKY Marcel

  Článek v odborném periodiku

  Antioxidants, rok: 2023, ročník: 12, vydání: 7, DOI

• Computer-assisted stabilization of fibroblast growth factor FGF-18

  VILÍM Jan GHAZALOVÁ Tereza PETULOVÁ Eliška HORACKOVA Aneta STEPANKOVA Veronika CHALOUPKOVÁ Radka BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2023, ročník: 21, vydání: October 2023, DOI

• Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate

  NEMERGUT Michal MARQUES Sérgio Manuel UHRÍK Lukáš VÁŇOVÁ Tereza NEZVEDOVÁ Markéta GADARA Darshak Chandulal JHA Durga TULIS Jan NOVÁKOVÁ Veronika PLANAS IGLESIAS Joan KUNKA Antonín LEGRAND Anthony Thomas P HŘÍBKOVÁ Hana POSPÍŠILOVÁ Veronika SEDMÍK Jiří RAŠKA Jan PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří BOHAČIAKOVÁ Dáša SPÁČIL Zdeněk HERNYCHOVÁ Lenka BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Molecular Neurodegeneration, rok: 2023, ročník: 18, vydání: 1, DOI